| 水稻条纹病毒中国分离物和日本分离物RNA2节段序列比较 |
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| 引用本文： | 魏太云,林含新,吴祖建,林奇英,谢联辉.水稻条纹病毒中国分离物和日本分离物RNA2节段序列比较[J].中国病毒学,2003,18(4):381-386. |
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| 作者姓名： | 魏太云 林含新 吴祖建 林奇英 谢联辉 |
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| 作者单位： | 福建农林大学植物病毒研究所,福建福州,350002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，全国高等学校优秀博士学位论文作者专项基金 |
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| 摘 要： | 测定了来源于我国水稻条纹叶枯病常年流行区的云南楚雄(CX)及病害暴发区的江苏洪泽(HZ)的水稻条纹病毒(RSV)2个分离物RNA2全长序列,其长度分别为3506bp和3514
bp.与已报道的日本T和O分离物RNA2序列进行比较的结果表明,这4个分离物可分为两组,其中,HZ、T和O分离物为一组,组内分离物之间,RNA2的毒义链(vRNA2)及RNA2的毒义互补链(vcRNA2)上的ORF的核苷酸一致性分别为97.2%～98.0%和96.8%～97.1%,5′端和3′端非编码区的序列则完全一致.但HZ分离物与T分离物的亲缘关系更为密切,其基因间隔区(IR)与T和O分离物的等长.另一组为我国CX分离物,组与组之间,vRNA2及vcRNA2上的ORF的核苷酸一致性分别为95.0%～95.7%和93.9%～94.4%.CX分离物的IR与HZ分离物相比缺失了一段8
nt的片段.5′端非编码区的序列完全一致,但3′末端非编码区有一个碱基的差异.这些结果表明,RSV在自然界的分子变异与其地理分布具有密切的关系.此外,非编码区序列的高度保守性暗示着它们在病毒基因转录和复制的调控方面具有重要的功能.本文还讨论了RSV的分子流行病学.
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| 关 键 词： | 水稻条纹病毒 序列分析 亲缘关系 |
Comparison of the RNA2 Segments Between Chinese Isolates and Japanese Isolates of Rice Stripe Virus |
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| Abstract.Comparison of the RNA2 Segments Between Chinese Isolates and Japanese Isolates of Rice Stripe Virus[J].Virologica Sinica,2003,18(4):381-386. |
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| Authors: | Abstract |
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| Keywords: | Rice stripe virus(RSV) Sequences analysis Evolutionary relationship |
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