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番茄LeABI3基因的生物信息学分析
引用本文:范晶,黄明远,李仲芳,梁梓,伏秦超,雷常安. 番茄LeABI3基因的生物信息学分析[J]. 生物技术通报, 2009, 0(11)
作者姓名:范晶  黄明远  李仲芳  梁梓  伏秦超  雷常安
作者单位:乐山师范学院化学与生命科学学院,乐山,614004
基金项目:四川省教育厅基金,乐山师范学院科研启动项目,峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目 
摘    要:对所克隆到的番茄LeABI3基因测序结果进行序列分析,发现得到LeABI3基因的2种转录本.应用生物信息学的方法和工具对LeABI3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域和同源树进行分析,结果表明此蛋白是包含一个保守B3结构功能域的亲水性不稳定蛋白,相对分子量为65.4 kD,等电点为6.54,可能存在2个跨膜区域.蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,蛋白质同源分析发现番茄LeABI3和马铃薯vp1-ABI3类蛋白相似度最高,同源性为89%.

关 键 词:番茄  LeABI3基因  生物信息学

Bioinformatics Analysis of LeABI3 Gene in Tomato
Fan Jing,Huang Mingyuan,Li Zhongfang,Liang Zi,Fu Qinchao,Lei Changan. Bioinformatics Analysis of LeABI3 Gene in Tomato[J]. Biotechnology Bulletin, 2009, 0(11)
Authors:Fan Jing  Huang Mingyuan  Li Zhongfang  Liang Zi  Fu Qinchao  Lei Changan
Abstract:
Keywords:Tomato  LeABI3 gene  Bioinformatics
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