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| 基于联合残基力场的蛋白质能量优化 | |
| 引用本文： | 崔光照,朱永锋,黄布毅,许进. 基于联合残基力场的蛋白质能量优化[J]. 生物信息学, 2005, 3(3): 130-132 |
| 作者姓名： | 崔光照 朱永锋 黄布毅 许进 |
| 作者单位： | 1. 郑州轻工业学院,电气信息工程学院,河南,郑州,450002;华中科技大学自动化学,湖北,武汉,430074 2. 郑州轻工业学院,电气信息工程学院,河南,郑州,450002 3. 华中科技大学自动化学,湖北,武汉,430074 |
| 基金项目： | 河南省自然科学基金资助项目(0211050900) |
| 摘 要： | 简述了蛋白质结构预测中存在的问题,主要介绍了蛋白质分子力场的一种模型即联合残基力场,然后利用这种模型对一种多肽和葡萄球菌蛋白的部分段进行试验,使它们的能量不同程度的得到了最小化,其中前者的初始能量为-71.50461kcal/mol,最小化后为-73.32767kcal/mol. |
| 关 键 词： | 蛋白质结构预测 联合残基力场 能量最小化 |
| 文章编号： | 1672-5565（2005）-03-130-03 |
| 收稿时间： | 2004-10-31 |
| 修稿时间： | 2005-05-19 |
Protein energy minimization based on UNRES |
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| CUI Guang-zhao,ZHU Yong-feng,HUANG Bu-yi,XU Jin. Protein energy minimization based on UNRES[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2005, 3(3): 130-132 | |
| Authors: | CUI Guang-zhao ZHU Yong-feng HUANG Bu-yi XU Jin |
| Abstract: | A brief summary of the problems in protein structure prediction is give at first,then united residue force field is introduced and based on this force field energy minimization of Ac-Ala19-NHMe and the 10-55 fragment of the B-domain of staphylococcal protein A is carried out.The energy of staphylococcal protein A fragment before and after are respectively -81.31822 kcal/moland -144.8705 kcal/mol,which justifies the validity of UNRES. |
| Keywords: | Protein structure prediction UNRES energy minmization |
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