| 基于高通量测序的阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)幼虫转录组分析 |
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| 引用本文： | 孙涛,张示渊,王岩,陈创夫.基于高通量测序的阿尔泰蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)幼虫转录组分析[J].环境昆虫学报,2021,43(6):1493-1503. |
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| 作者姓名： | 孙涛 张示渊 王岩 陈创夫 |
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| 作者单位： | 石河子大学医学院;石河子大学第三附属医院(石河子市人民医院);石河子大学第三附属医院(石河子市人民医院);石河子大学医学院;石河子大学动物科技学院;石河子大学畜牧学博士后流动站,新疆维吾尔自治区石河子市 832000;石河子大学动物科技学院;石河子大学畜牧学博士后流动站,新疆维吾尔自治区石河子市 832000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(32060125，81560614)；中国博士后科学基金(2016M602907)；西部地区高发人兽共患传染性疾病防控协同创新中心项目 |
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| 摘 要： | 本研究采用Illumina HiSeq TM 2500测序平台对阿尔泰蝠蛾Hepialus altaicola Wang幼虫进行转录组测序及生物信息学分析.经序列拼接后共获得100133个Unigenes,总长度86319112 bp,平均长度862 bp,N50长度1628 bp.将Unigenes与NR、COG/KOG、Pfam、Swiss-Prot、GO、KEGG数据库比对,共获得38198条Unigenes,其中Nr数据库注释的Unigenes最多,为32381条,占32.34％.通过GO功能分类,共有13216个Unigenes在GO数据库中细胞组分、分子功能和生物学过程等3大类57个分支中找到注释;KEGG通路分析,共有15058条Unigenes被注释,归属于305条代谢通路.CDS预测发现54002条序列可被编码,占全部基因的53.93％.基因注释进一步获得311个与冷适应相关的代谢调节基因,并用FPKM值对基因表达量进行评估.本研究获得的转录组信息及分析结果,为进一步研究阿尔泰蝠蛾的基因功能及低温生态适应性奠定分子基础.
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| 关 键 词： | 阿尔泰蝠蛾 转录组 基因注释 高通量测序 生物信息学 |
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