| 3株杂色鲍致病菌--副溶血弧菌的16S-23S rDNA间区序列的分析 |
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| 引用本文： | 邓先余,王智学,何建国. 3株杂色鲍致病菌--副溶血弧菌的16S-23S rDNA间区序列的分析[J]. 微生物学报, 2004, 44(3): 304-308 |
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| 作者姓名： | 邓先余 王智学 何建国 |
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| 作者单位： | 中山大学生命科学学院,广州,510275 |
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| 基金项目： | 国家"863计划"(2001AA622020);广东省科技厅专项资助项目(2KB05301N) |
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| 摘 要： | 以细菌的 1 6SrDNA 3′端和 2 3SrDNA 5′端的高度保守区为引物 ,扩增了 3株杂色鲍致病菌—副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)的 1 6S 2 3SrDNA间区 ,克隆到pGEM T载体上 ,测序。用BLAST和DNAstar软件对 1 6S 2 3SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析。结果表明副溶血弧菌ZSU0 0 8和ZSU0 0 9测出的 1 6S 2 3SrDNA间区均有 6条 ,间区类型也相同 ,分别为IGSGLAV 、IGSGLV、IGSAG、IGSIA、IGSG 和IGS0 。其中IGSGLAV最大 ,包含tRNAGlu、tR NALys、tRNAAla和tRNAVal基因 ;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因 ;IGSAG包含tRNAAla和tRNAGlu基因 ;IGSIA,则为tRNAIle和tRNAAla基因 ;IGSG 仅包含tRNAGlu基因 ;而IGS0 最小 ,未包含任何tRNA。菌株ZSU0 1 0测出的 1 6S 2 3SrDNAIGS序列有 5条 ,除缺少IGSAG 外 ,其余的IGS类型均与ZSU0 0 8和ZSU0 0 9相同。与GenBank内的副溶血弧菌IGS序列比较 ,发现副溶血弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性。 1 6S 2 3SrDNA间区结构的差异为建立一种新的副溶血弧菌检测方法奠定了基础。
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| 关 键 词： | 副溶血弧菌 16S23SrDNA间区 tRNA基因 |
| 文章编号： | 0001-6209(2004)03-0304-05 |
| 修稿时间： | 2003-07-08 |
Analysis of The 16S-23S rDNA Intergenic Spacers(IGSs) of 3 Strains of Vibrio parahaemolyticus,A Pathogen of Abalone (Haliotis diversicolor) |
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| DENG Xian-Yu WANG Zhi-Xue HE Jian-Guo. Analysis of The 16S-23S rDNA Intergenic Spacers(IGSs) of 3 Strains of Vibrio parahaemolyticus,A Pathogen of Abalone (Haliotis diversicolor)[J]. Acta microbiologica Sinica, 2004, 44(3): 304-308 |
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| Authors: | DENG Xian-Yu WANG Zhi-Xue HE Jian-Guo |
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| Affiliation: | DENG Xian-Yu WANG Zhi-Xue HE Jian-Guo * |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Vibrio parahaemolyticus 16S-23S rDNA intergenic spacers tRNA gene |
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