版纳微型猪近交系TDRP1基因克隆、鉴定及mRNA的组织表达特性 |
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引用本文: | 王配,霍金龙,王淑燕,潘伟荣,查星琴,施晨,曾养志.版纳微型猪近交系TDRP1基因克隆、鉴定及mRNA的组织表达特性[J].中国实验动物学报,2014(6):9-16. |
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作者姓名: | 王配 霍金龙 王淑燕 潘伟荣 查星琴 施晨 曾养志 |
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作者单位: | 云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室;云南农业大学动物科学技术学院; |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(No.31160439,31460580) |
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摘 要: | 目的克隆版纳微型猪近交系(BMI)不育和可育公猪TDRP1基因,分析其序列及mRNA表达水平上的差异,预测其蛋白质功能,并检测该基因在可育公猪中的组织表达分布情况。方法以猪NM_001198925序列为模板,设计特异引物,采用RT-PCR方法结合测序获得TDRP1的c DNA序列并进行生物信息学分析;采用半定量PCR方法检测TDRP1在不育和可育公猪睾丸中的表达规律,分析该基因在可育公猪17种组织中的表达特征。结果获得了BMI TDRP1基因的编码区序列(Gen Bank登录号:KJ186786),生物信息学分析表明其编码186个氨基酸,蛋白质相对分子质量(Mw)为20.49×10^3,等电点(p I)为5.86,无信号肽,有94.1%的概率位于细胞核,含有1个亮氨酸富集的核输出信号。不同物种的氨基酸序列比对表明猪TDRP1与人、恒河猴、小鼠和大鼠等哺乳动物的TDRP1相似性在73%-83.2%之间,其中与人、恒河猴的相似性较高。mRNA表达分析表明,TDRP1在BMI不育和可育公猪睾丸间表达水平差异无显著,在精囊腺和前列腺中高表达,在睾丸和小脑中中度表达,在大脑和肾脏中低表达,在其余组织中不表达。结论成功克隆了BMI TDRP1基因的全长编码区序列并发现了BMI特有的2个SNP位点;TDRP1基因在BMI不育和可育公猪间序列完全一致,睾丸mRNA表达水平差异无显著性,多组织转录谱分析表明该基因存在明显的组织差异表达现象,在精囊腺和前列腺中有较高表达量,为深入研究TDRP1基因在精子发生方面的作用奠定了基础。
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关 键 词: | 精子发生相关蛋白1 精子发生 版纳微型猪近交系 生物信息学 组织表达特性 |
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