| 柯萨奇病毒A组16型河南省分离株基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 黄学勇,许玉玲,卫海燕,武景福,康锴,王彦霞,陈豪敏,许汴利. 柯萨奇病毒A组16型河南省分离株基因组序列分析[J]. 病毒学报, 2012, 28(2): 118-123 |
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| 作者姓名： | 黄学勇 许玉玲 卫海燕 武景福 康锴 王彦霞 陈豪敏 许汴利 |
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| 作者单位： | 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所,郑州,450016;河南省三门峡市疾病预防控制中心,三门峡市,472000 |
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| 基金项目： | 河南省医学科技重大攻关项目(201001015) |
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| 摘 要： | 为了解河南省手足口病患者标本中分离柯萨奇A组的16型(CoxAl6)病毒基因组特征,对2010年采集的手足口病患者临床标本406份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;通过10对引物分段扩增和拼接CoxAl6分离株基因组序列,利用生物信息学软件对序列分析,构建序列遗传发育树。测序获得河南省CoxAl6分离株HN1162/HN/CHN/2010基因组全长序列7 411bp,5′非编码区(5′UTR)、P1、P2、P3、3′非编码区(3′UTR)区域核苷酸序列与GenBank公布的其它分离株相似性分别为87.0%～97.9%、77.0%～95.4%、80.3%～96.9%、77.9%～96.2%、80.5%～100%;VP1区核苷酸相似性为91.4%～96.4%,氨基酸相似性为99.3%～99.7%;遗传发育树分析表明与我国深圳、广州、福建分离株处于同一分支。河南省手足口病患者标本CoxAl6病毒分离株属于C2基因亚型/B-2基因亚型,对加强该病毒变异检测,预防控制手足口病疫情具有重要意义。
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| 关 键 词： | CoxA16病毒 基因组 序列 遗传发育 |
Genomic characteristics of coxsakievirus A16 isolated in Henan Province |
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| Huang Xue-Yong,Xu Yu-Ling,Wei Hai-Yan,Wu Jing-Fu,Kang Kai,Wang Yan-Xia,Chen Hao-Min,Xu Bian-Li. Genomic characteristics of coxsakievirus A16 isolated in Henan Province[J]. Chinese journal of virology, 2012, 28(2): 118-123 |
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| Authors: | Huang Xue-Yong Xu Yu-Ling Wei Hai-Yan Wu Jing-Fu Kang Kai Wang Yan-Xia Chen Hao-Min Xu Bian-Li |
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| Affiliation: | Department of Infectious Disease Control and Prevention, Henan Provincial Center for Disease Prevention and Control, Zhengzhou 450016, China. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Coxsackievirus A16 Genome Sequences Phylogenetic tree |
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