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茶树CsDREB-A1转录因子基因的克隆及其特性分析
引用本文:刘志薇,吴致君,黎星辉,李彤,庄静. 茶树CsDREB-A1转录因子基因的克隆及其特性分析[J]. 植物资源与环境学报, 2014, 0(4): 8-16
作者姓名:刘志薇  吴致君  黎星辉  李彤  庄静
作者单位:南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31200520);江苏省自然科学基金资助项目(BK2012774);教育部博士点基金项目(20120097120031);中国博士后科学基金项目(2013M541686);国家大学生创新创业训练计划项目(201410307030)
摘    要:基于茶树品种‘迎霜’(Camellia sinensis‘Yingshuang’)的转录组数据,采用PCR方法从其基因组DNA中克隆获得编码DREB转录因子的CsDREB-A1基因。结果显示:该基因的开放阅读框(ORF)长度为585 bp,编码194个氨基酸,该氨基酸序列即为CsDREB-A1转录因子。CsDREB-A1转录因子的N端含有AP2/ERF家族转录因子典型的AP2 DNA保守结合结构域,其中包含保守的YRG元件和WLG基序,且其第14位和第19位分别为缬氨酸和谷氨酸,该结构域的上、下游分别有PKK/RPAGRx KFx ETRHP和DSAW特征序列。通过进化分析可知CsDREB-A1转录因子属于AP2/ERF家族中DREB亚族的A1组,其与茶树CBF转录因子的相似性较高,与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕等植物的DREB类转录因子也有较高的相似性。CsDREB-A1转录因子为亲水性蛋白,理论相对分子质量为21 165.4,理论等电点为p I 9.56,碱性、酸性、芳香族和脂肪族氨基酸比例分别为18%、10%、6%和18%;该转录因子只有1个包含53个氨基酸的无序化区域,且大部分无序化氨基酸位于AP2DNA保守结合结构域内,无序化氨基酸的比例为27.32%;在CsDREB-A1转录因子的三级结构中,N端有1个α螺旋、C端有3个β折叠。研究结果显示:CsDREB-A1转录因子可能与茶树的抗寒性相关。

关 键 词:茶树  CsDREB-A1基因  转录因子  抗寒性

Gene cloning of Cs DREB-A1 transcription factor from Camellia sinensis and its characteristic analysis
LIU Zhiwei;WU Zhijun;LI Xinghui;LI Tong;ZHUANG Jing. Gene cloning of Cs DREB-A1 transcription factor from Camellia sinensis and its characteristic analysis[J]. Journal of Plant Resources and Environment, 2014, 0(4): 8-16
Authors:LIU Zhiwei  WU Zhijun  LI Xinghui  LI Tong  ZHUANG Jing
Affiliation:LIU Zhiwei;WU Zhijun;LI Xinghui;LI Tong;ZHUANG Jing;Tea Research Institute,College of Horticulture,Nanjing Agricultural University;
Abstract:
Keywords:
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