| 人类正常胃肠道组织基因表达谱特征的生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | Wang GS Cui WW Wu BY Wang MW |
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| 作者单位： | [1]解放军总医院南楼消化科,北京100853 [2]美国国立卫生院生物技术信息中心信息工程部,北京100853 |
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| 基金项目： | 军队计划医药卫生国际合作项目 |
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| 摘 要： | 目的:筛选人类正常胃肠道组织特异性高表达基因.方法:以公开发表的人类正常组织基因表达数据库资料为研究对象,应用单侧 Student T检验筛选胃、回肠和结肠组织的特异性高表达基因.Ingenuity软件和KEGG分析特异性高表达基因相关的生理功能;Cluster软件分析胃特异性高表达基因谱在胃癌基因数据库中的表达特征.结果:筛选出胃高表达基因196个,回肠高表达基因203个,结肠高表达基因224个,高表达基因的功能与胃肠道的主要生理功能相吻合.筛选出的正常胃肠高表达基因中含有一些癌基因和抑癌基因.系统聚类分析发现胃特异性高表达基因在胃癌数据库的胃正常组织中高表达,而相应的胃癌组织低表达,癌组织和正常组织可以完好聚类分组,并且可以区分中分化和低分化胃癌.结论:人类正常胃、回肠和结肠具有组织特异的与生理功能密切相关的高表达基因群.
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| 关 键 词： | 人类 胃 回肠 结肠 基因表达 生物信息学 |
Gene expression profile of human normal gastrointestinal tract tissues: bioinformatic study |
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| Wang GS,Cui WW,Wu BY,Wang MW.Gene expression profile of human normal gastrointestinal tract tissues: bioinformatic study[J].Chinese Journal of Applied Physiology,2008,24(3):334-337,I0004. |
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| Authors: | Wang Gang-Shi Cui Wen-Wu Wu Ben-Yan Wang Meng-Wei |
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| Institution: | Department of Gerontal Gastroenterology, General Hospital of Chinese PLA, Beijing 100853, China. wanggangshi@hotmail.com |
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| Abstract: | |
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