人类miRNA上游转录因子及下游靶基因的基因本体分析 |
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引用本文: | 来文楠,习杨,吕湘,刘德培.人类miRNA上游转录因子及下游靶基因的基因本体分析[J].中国微生态学杂志,2011,23(8):712-713,716. |
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作者姓名: | 来文楠 习杨 吕湘 刘德培 |
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作者单位: | 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室,北京,100005 |
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摘 要: | 目的研究人类miRNA转录因子及靶基因之间的相关关系。方法利用生物信息学方法预测miR-NA的上游转录因子和下游靶基因,并对预测结果做基因本体分析,得到参与各生物学过程及分子功能的比例,用统计学软件PASW做相关性分析。结果人类382个miRNA参与应激、代谢、发育等10个生物学过程和行使转录调控、翻译调控、催化活性等12个分子功能,miRNA上游转录因子之间、下游靶基因之间以及上下游之间存在着广泛的正负相关关系。结论基因在参与生物学过程及行使分子功能的过程中,通过miRNA实现协同作用或隔离效应。
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关 键 词: | miRNA 生物信息学 基因本体 |
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