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多耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药基因检测及指标聚类分析
引用本文:陈菁,孙桂芹. 多耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药基因检测及指标聚类分析[J]. 中国微生态学杂志, 2011, 23(8): 723-728
作者姓名:陈菁  孙桂芹
作者单位:绍兴市人民医院检验科,浙江绍兴,312000
摘    要:
目的调查多耐药肺炎克雷伯菌中65种获得性耐药基因和7种可移动遗传元件遗传标记基因的存在状况,以及获得性耐药基因和可移动遗传元件遗传标记基因的相关性。方法收集绍兴地区六家医院分离的肺炎克雷伯菌共20株,采用PCR的方法分析65种β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类获得性耐药基因和7种转座子、插入序列、接合性质粒遗传标记基因,并用指标聚类分析(SPSS法)分析β-内酰胺类、氨基糖苷类和喹诺酮类获得性耐药基因与整合子、转座子、插入序列、接合性质粒遗传标记基因的相关性。结果 20株肺炎克雷伯菌共检测到14种获得性耐药基因(包括6种β-酰胺类获得性耐药基因、6种氨基糖苷类获得性耐药基因、2种喹诺酮类获得性耐药基因)和6种可移动遗传元件遗传标记基因(包括1种整合子遗传标记基因、3种转座子和插入序列基因遗传标记基因、2种接合性质粒遗传标记基因),其余52种基因均未检测到。SPSS法将上述阳性检出基因分成两大簇群。结论绍兴地区六家医院的多耐药肺炎克雷伯菌菌株对抗菌药物的耐药表型与获得性耐药基因相关,且可移动遗传元件的水平转移使细菌的耐药性在同种细菌菌株之间甚至不同种细菌菌株之间得以快速传播。获得性耐药基因与可移动遗传元件遗传标记基因的指标聚类分析显示:OXA-1、aac(6’)-Ⅰb、qnrB、IMP、aadA5、VEB、KPC、qnrS等基因与接合性质粒遗传标记traA相关,提示这些基因在F接合性质粒上;DHA、aph(3′)-Ⅰ等基因与转座子遗传标记tnpU、tnp513相关,提示它们位于转座子上;TEM-1、aac(3)-Ⅱ、qacE△1与接合性质粒遗传标记trbC相关,提示TEM-1、aac(3)-Ⅱ等基因和Ⅰ类整合子可能位于宽范围接合性质粒上;ant(3″)-Ⅰ、rmtB等基因与ISEcp1较为相关,提示这些基因位于插入序列上。

关 键 词:肺炎克雷伯菌  获得性耐药基因  可移动遗传元件  指标聚类分析  多耐药

The investigation of acquired resistance genes and hierarchical cluster analysis in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae
CHEN Jing,SUN Gui-qin. The investigation of acquired resistance genes and hierarchical cluster analysis in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae[J]. Chinese Journal of Microecology, 2011, 23(8): 723-728
Authors:CHEN Jing  SUN Gui-qin
Affiliation:CHEN Jing,SUN Gui-qin (Shaoxing People's Hospital,Shaoxing 312000,China)
Abstract:
Objective To investigate the distribution of 65 kinds of acquired resistance genes and 7 kinds of genetic markers of mobile genetic elements,and the correlation between acquired resistance genes and genetic markers of mobile genetic elements in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae(K.pneumoniae).Method From October 2007 to June 2009,20 strains of multidrug-resistant K.pneumoniae were collected from Shaoxing People's Hospital,China.Then,65 kinds of acquired resistance genes to beta-lactams,aminoglycoside...
Keywords:K.pneumoniae  Acquired resistance gene  Mobile genetic element  Hierarchical cluster analysis  Multidrug-resistance  
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