|
|||||
|
|
| 三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析 | |
| 引用本文： | 李学梅,余育和,解绶启,颜庆云,陈宇航,董小林. 三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析[J]. 水生生物学报, 2011, 35(3): 423-429. DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00423 |
| 作者姓名： | 李学梅 余育和 解绶启 颜庆云 陈宇航 董小林 |
| 作者单位： | 1. 中国科学院水生生物研究所,中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室,武汉,430072;中国科学院研究生院,北京,100049 2. 中国科学院水生生物研究所,中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室,武汉,430072 3. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072 4. 中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072;中国科学院研究生院,北京,100049 |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划，国家自然科学基金 |
| 摘 要： | 以室内饲养的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究。在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少。基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在显著差异(P0.05),而银鲫和异育银鲫之间无显著差异(P=0.383)。在斑点叉尾肠道中检测到的菌群主要是变形杆菌,包括-变形杆菌和-变形杆菌;而银鲫和异育银鲫肠道中菌群主要包括梭杆菌属中的类群,还包括变形杆菌门中的气单胞菌属,以及一些未知的类群。以上结果均表明在所研究的三种鱼的幼鱼阶段,其肠道微生物组成在不同种类鱼中存在差异,且该差异受基因型的影响可能更大。 |
| 关 键 词： | 斑点叉尾 银鲫 异育银鲫 PCR-DGGE 肠道微生物群落 |
PCR-DGGE FINGERPRINTING ANALYSIS ON INTESTINAL MICROBIAL COMMUNITY OF THREE INDOOR REARING FISHES |
|
| LI Xue-Mei,YU Yu-He,XIE Shou-Qi,YAN Qing-Yun,CHEN Yu-Hang,DONG Xiao-Lin. PCR-DGGE FINGERPRINTING ANALYSIS ON INTESTINAL MICROBIAL COMMUNITY OF THREE INDOOR REARING FISHES[J]. Acta Hydrobiologica Sinica, 2011, 35(3): 423-429. DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00423 | |
| Authors: | LI Xue-Mei YU Yu-He XIE Shou-Qi YAN Qing-Yun CHEN Yu-Hang DONG Xiao-Lin |
| Affiliation: | LI Xue-Mei1,3,YU Yu-He1,XIE Shou-Qi2,YAN Qing-Yun1,CHEN Yu-Hang2,3 and DONG Xiao-Lin2,3(1.Key Laboratory of Biodiversity and Conservation of Aquatic Organisms,Institute of Hydrobiology,Chinese Academy of Sciences,Wuhan 430072,China,2.State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology,3.Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | PCR-DGGE |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《水生生物学报》浏览原始摘要信息 | |
| 点击此处可从《水生生物学报》下载全文 | |