MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用———基因表达图谱分析(4)* |
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引用本文: | 杨英杰李红燕云慧刘新星.MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用———基因表达图谱分析(4)*[J].现代生物医学进展,2012,12(20):3938-3942. |
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作者姓名: | 杨英杰李红燕云慧刘新星 |
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作者单位: | 中南大学生物冶金教育部重点实验,室湖南长沙,410083 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(50774102)提供资助 |
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摘 要: | 基因表达图谱原则上可了解整体细胞基因表达的信息,是基因组功能分析的重要研究手段。MATLAB 7.X生物信息工具箱为基因表达谱数据的分析和处理提供了一个综合环境,通过众多统计函数和绘图函数的结合使用,过滤不合格的基因数据和噪声数据,从而对基因表达数据进行聚类分析和主成分分析,绘制相关的基因表达图谱,完成基因芯片数据表达图谱的分析,分析结果可视化程度高,图表清晰、直观。本文主要以酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae为例,详细描述了利用MATLAB 7.X生物信息工具箱对其基因表达图谱进行分析的过程。
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关 键 词: | 基因芯片 生物信息工具箱 聚类分析 主成分分析 |
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