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BtBar基因转化对水稻不同组织生态位微生物群落组成及潜在功能影响
引用本文:葛蕾,王璐瑶,郭官清,宋丽莉,王翠,汪小福,毛婵娟,李鹏. BtBar基因转化对水稻不同组织生态位微生物群落组成及潜在功能影响[J]. 微生物学报, 2024, 64(5): 1607-1625
作者姓名:葛蕾  王璐瑶  郭官清  宋丽莉  王翠  汪小福  毛婵娟  李鹏
作者单位:上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306;上海市农业科学院生物技术研究所 上海市农业遗传育种重点实验室, 上海 201106;浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所, 浙江 杭州 310022;上海师范大学生命科学学院, 上海 200233
基金项目:国家自然科学基金(32071657);上海市农业科学院攀高计划(PG23211)
摘    要:【目的】转Bt基因和Bar基因植物的微生态效应是环境安全评价的重要因素,但关于Bt基因和Bar基因转化引起的水稻基因型改变对水稻不同组织生态位微生物群落组成和潜在功能的影响还无系统研究。【方法】以转Bt基因和Bar基因水稻T1C-1及其亲本对照Minghui63为研究对象,基于细菌16S rRNA基因和真菌ITS高通量测序技术,分析抽穗期T1C-1和Minghui63根际土壤微生物以及根、茎、叶内生菌的群落结构和潜在功能。【结果】细菌和真菌群落多样性在水稻不同组织生态位之间发生显著变化,地下部分组织生态位(根际土壤和根系)微生物多样性显著高于地上部分(叶和茎)。T1C-1显著影响叶片内生真菌的香农指数和辛普森指数,而对茎和根的内生菌以及根际土壤微生物多样性无显著影响。叶片内生真菌曲霉菌属(Aspergillus)和篮状菌属(Talaromyces)相对丰度在T1C-1显著增加,推测其参与碳素代谢、能量代谢和转录作用酶合成等过程。T1C-1和Minghui63微生物群落关联网络分析表明,T1C-1的平均聚类系数和平均度显著高于Minghui63,因而T1C-1提高了相关微生物群落网络复杂程度。通过重建未观测状态对群落进行系统发育研究(phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states, PICRUSt2),对叶片内生真菌功能酶基因进行功能预测,相对于Minghui63,T1C-1显著改变了碳素代谢、脂类代谢和能量代谢等途径。【结论】相较于根际土壤,叶片内生真菌的群落组成和潜在功能对T1C-1更敏感。尽管如此,T1C-1并未导致叶片内生真菌的多样性指数降低。为了更准确地评估转基因植物的微生态效应,我们需要加强对不同组织生态位内生菌多样性的关注。

关 键 词:内生菌  生态位  根际微生物  Bt基因  微生物群落网络
收稿时间:2023-12-13
修稿时间:2024-02-22

Effects of Bt and Bar transformation on microbial community composition and potential functions in different tissues of rice plants
Ge Lei,Wang Luyao,Guo Guanqing,Song Lili,Wang Cui,Wang Xiaofu,Mao Chanjuan,Li Peng. Effects of Bt and Bar transformation on microbial community composition and potential functions in different tissues of rice plants[J]. Acta microbiologica Sinica, 2024, 64(5): 1607-1625
Authors:Ge Lei  Wang Luyao  Guo Guanqing  Song Lili  Wang Cui  Wang Xiaofu  Mao Chanjuan  Li Peng
Affiliation:College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding, Biotechnology Research Institute, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201106, China;Institute of Agro-product Safety and Nutrition, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310022, Zhejiang, China;College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200233, China
Abstract:
Keywords:endophytic microorganisms  ecological niche  rhizosphere microorganism  Bt gene  microbial community network
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