甲型流感病毒H5N1的系统进化分析简评

美国加州大学Robert G.Wallace,Richard H.Lathrop和Walter M.Fitch等人在2007年3月7日电子版(13日正式出版)的PNAS上发表文章,题目是:甲型流感病毒H5N1的系统进化地理学统计分析学(Astatistical phylogeography of influenza A H5N1)。该文发表以后,国内外流感病毒学者对此发生浓厚的兴趣,提出了一些对该文的评论。采用先进的生物信息学、数学模型等跨学科的先进方法进行病毒学的研究,特别是用来指导传染病预防和控制,是值得提倡和鼓励的,我国科学家应当认真学习;但是任何采用生物信息学方法做出的预测,还须经过病毒学实验研究的验证。以下发表的评述,仅供参考。百家争鸣才有利于科学的进步。

A Commentary on Phylogenetic Analysis of H5N1 Influenza A Viruses

A recent study based on statistical phylogeography of 192 hemagglutinin and neuraminidase nucleotide sequences of H5N1 influenza A viruses suggested that Guangdong Province of China is the source of multiple H5N1 strains spreading at both regional and international levels.This study is flawed and its conclusions are not justified.Insufficient sampling,sampling bias,possible sequencing errors and the omission of other gene segments from analysis are some of the major concerns.