| 海生杆菌属的基因组测序数据分析 |
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| 引用本文： | 王梦汝,席威,李正军. 海生杆菌属的基因组测序数据分析[J]. 生物工程学报, 2020, 36(12): 2695-2706 |
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| 作者姓名： | 王梦汝 席威 李正军 |
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| 作者单位： | 北京化工大学 生命科学与技术学院，北京 100029 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划 (No. 2018YFA0900200)，国家自然科学基金 (No. 31870075) 资助。 |
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| 摘 要： | 海生杆菌属首次于1997年鉴定,迄今包括18个物种,其中10个已完成全基因组序列测定。文中总结了海生杆菌属的菌种特征,并从碳源利用、聚羟基脂肪酸酯代谢和芳香族化合物降解三个方面对基因组测序数据进行了分析。研究发现,海生杆菌属具有完整的糖酵解途径和三羧酸循环,缺乏木糖利用基因。所有海生杆菌属菌种均含有Ⅰ型和Ⅲ型聚羟基脂肪酸酯合成酶的编码基因,表明该菌属可能具有普遍的聚羟基脂肪酸酯合成能力。海生杆菌属含有芳香族化合物的降解途径,苯、苯酚和苯甲酸可由不同的酶催化生成邻苯二酚,再由邻位断裂途径降解为3-酮己二酸,邻苯二酚也可由间位断裂途径降解为丙酮酸和乙酰辅酶A。基因组测序数据分析加深了对海生杆菌属代谢特征的认识,提示该菌属在聚羟基脂肪酸酯合成和海洋芳香族污染物治理方面有一定的应用前景。
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| 关 键 词： | 海生杆菌属 基因组 测序 聚羟基脂肪酸酯 芳香族化合物 |
| 收稿时间： | 2020-06-22 |
Analysis of the genome sequencing data of the Marinobacterium genus |
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| Mengru Wang,Wei Xi,Zhengjun Li. Analysis of the genome sequencing data of the Marinobacterium genus[J]. Chinese journal of biotechnology, 2020, 36(12): 2695-2706 |
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| Authors: | Mengru Wang Wei Xi Zhengjun Li |
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| Affiliation: | College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Marinobacterium genome sequence polyhydroxyalkanoate aromatic compounds |
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