| 谷氨酸棒状杆菌集成细胞网络的构建与结构分析 |
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| 引用本文： | 姜金国,宋理富,郑平,贾士儒,孙际宾.谷氨酸棒状杆菌集成细胞网络的构建与结构分析[J].生物工程学报,2012,28(5):577-591. |
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| 作者姓名： | 姜金国 宋理富 郑平 贾士儒 孙际宾 |
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| 作者单位： | 天津科技大学生物工程学院，天津 300457；中国科学院天津工业生物技术研究所，天津 300308;中国科学院天津工业生物技术研究所，天津 300308；中国科学院系统微生物工程重点实验室，天津 300308;中国科学院天津工业生物技术研究所，天津 300308；中国科学院系统微生物工程重点实验室，天津 300308;天津科技大学生物工程学院，天津 300457;中国科学院天津工业生物技术研究所，天津 300308；中国科学院系统微生物工程重点实验室，天津 300308 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划 (973计划) (Nos. 2009CB724703, 2011CBA00804)，中国科学院知识创新工程重要方向性项目 (No. KSCX2-YW-G-030) 资助。 |
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| 摘 要： | 谷氨酸棒状杆菌是一种重要的传统工业微生物,其基因组学和分子遗传操作工具的快速发展使得谷氨酸棒状杆菌具备了作为新型细胞工厂的潜力。但是,相对于大肠杆菌等模式生物,对于棒杆菌的代谢调控研究较少,特别是目前还缺乏谷氨酸棒状杆菌集成细胞网络的研究,这一现状阻碍了谷氨酸棒状杆菌的系统生物学研究和大规模菌种理性设计优化。文中综合应用公共数据库、文献数据库资源,首次构建了谷氨酸棒状杆菌的集成细胞网络,包含1 384个反应,1 276个代谢物,88个调节子,999对转录调控关系。其转录调控可分为5层,代谢网络呈现出清晰的bow-tie结构。文中还以赖氨酸的生物合成为例,提出了一种提取代谢调控子网络的新方法,这对氨基酸等产品高产生物机制的研究和工程菌株的重新设计具有指导意义。
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| 关 键 词： | 谷氨酸棒状杆菌 转录调控网络 代谢网络 集成细胞网络 代谢调控子网络 赖氨酸生产 |
| 收稿时间： | 2011/10/21 0:00:00 |
Construction and structural analysis of integrated cellular network of Corynebacterium glutamicum |
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| Jinguo Jiang,Lifu Song,Ping Zheng,Shiru Jia and Jibin Sun.Construction and structural analysis of integrated cellular network of Corynebacterium glutamicum[J].Chinese Journal of Biotechnology,2012,28(5):577-591. |
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| Authors: | Jinguo Jiang Lifu Song Ping Zheng Shiru Jia and Jibin Sun |
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| Institution: | School of Biological Engineering, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, China; Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China;Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China; Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China;Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China; Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China;School of Biological Engineering, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, China;Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China; Key Laboratory of Systems Microbial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China |
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