| 高粱SBP-box基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 常建忠,闫凤霞,乔麟轶,郑军,张福耀,柳青山.高粱SBP-box基因家族全基因组鉴定及表达分析[J].遗传,2016,38(6):569-580. |
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| 作者姓名： | 常建忠 闫凤霞 乔麟轶 郑军 张福耀 柳青山 |
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| 作者单位： | 1. 山西省农业科学院旱地农业研究中心,农业部黄土高原作物基因资源和种质创制重点实验室,太原030031;2. 山西省农业科学院高粱研究所,高粱遗传与种质创新山西省重点实验室,晋中 030600;3. 山西省农业科学院作物科学研究所,太原030031 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项(编号：CARS-06-01-01),山西省财政支农项目(编号：2014ZYFZ-09),山西省农业科学院重点项目(编号：YZD1401)和山西省农业科学院博士研究基金项目(编号：YBSJJ1407)资助 |
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| 摘 要： | SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box (SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量、株型、抗逆性等,具有重要的实际应用价值。本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域。系统发育分析表明高粱SBP-box基因家族可分为6个亚家族,其中SbSBP12、SbSBP3和SbSBP15分别与玉米ZmLG1、ZmTGA1和ZmUB2/3直系同源。基于RNA-seq数据的表达分析发现高粱SBP-box基因在花序原基中表达量最高,SbSBP9和SbSBP17为花序原基特异表达基因,SbSBP5、SbSBP8和SbSBP18等基因受外源ABA和PEG胁迫上调表达,表明SBP-box基因可能参与高粱对非生物逆境的响应。本研究为高粱SBP-box家族重要基因的克隆提供了参考,相关基因可作为高粱遗传改良的候选基因。
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| 关 键 词： | 高粱 SBP-box基因家族 系统进化分析 表达分析 |
| 收稿时间： | 2016-01-17 |
Genome-wide identification and expression analysis of SBP-box gene family in Sorghum bicolor L. |
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| Institution: | 1. Dryland Agriculture Research Center, Shanxi Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, Taiyuan 030031, China;2. Sorghum Institute of Shanxi Academy of Agricultural Sciences/Shanxi Key Laboratory of Sorghum Genetic and Germplasm Innovation, Jinzhong 030600, China;3. Institute of Crop Science, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Taiyuan 030031, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sorghum bicolor L SBP-box gene family phylogenetic analysis expression analysis |
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