鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析 |
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引用本文: | 程敏,张文建,邢天宇,闫晓红,李玉茂,李辉,王宁.鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析[J].遗传,2016,38(8):724-735. |
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作者姓名: | 程敏 张文建 邢天宇 闫晓红 李玉茂 李辉 王宁 |
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作者单位: | 1. 农业部鸡遗传育种重点实验室,哈尔滨 150030; 2. 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,哈尔滨 150030; 3. 东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(编号:31372299)和农业部产业体系项目(编号:CARS-42)资助 |
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摘 要: | miR-17-92基因簇(miR-17-92 cluster)在细胞增殖、分化、凋亡、动物发育以及肿瘤发生等过程中发挥重要作用。目前,人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇的转录调控已有深入研究,但该基因簇在鸡等鸟类中的转录调控研究还未见报道,主要原因在于鸟类miR-17-92基因簇上游的基因组序列都存在一个gap,且该基因簇启动子的位置和序列也还不清楚。为此,本研究采用染色体步移的方法获得鸡miR-17-92基因簇上游gap区序列,并采用生物信息学分析和报告基因及截短突变技术开展该gap区的功能分析。染色体步移分析发现,鸡miR-17-92基因簇上游gap区全长1704 bp,GC含量达80.11%。生物信息学分析显示,鸡miR-17-92基因簇上游gap区内1段200 bp的序列与人、牛、小鼠等9种动物miR-17-92基因簇上游序列保守性较高,且该区域为人和小鼠等哺乳动物miR-17-92基因簇宿主基因的核心启动子区。将克隆的gap区序列插入pGL3 basic荧光素酶报告基因载体,构建成启动子荧光素酶报告基因载体pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)。荧光素酶报告基因活性分析表明,pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)报告基因的活性是pGL3 basic空载体活性的417倍,证明所克隆的gap区片段是鸡miR-17-92基因簇宿主基因的启动子。为进一步分析该启动子的结构和功能,构建gap区片段的5°端缺失突变(缺失448 bp)和3°端缺失突变(缺失894 bp)的荧光素酶报告基因载体。与pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)相比,5°端和3°端缺失突变分别使启动子报告基因活性降低19.82%和60.14%。这些数据提示,鸡miR-17-92基因簇宿主基因启动子的重要调控区位于-3400/-2506。本研究结果为进一步开展鸡miR-17-92基因簇的转录调控奠定了基础。
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关 键 词: | 鸡 miR-17-92基因簇 启动子 转录调控 |
收稿时间: | 2016-03-08 |
Functional analysis of the upstream regulatory region of chicken miR-17-92 cluster |
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Institution: | 1. Key Laboratory of Chicken Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture, Harbin 150030, China; 2. Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Education Department of Heilongjiang Province, Harbin 150030, China; 3. College of Animal Science and Technology, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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