| 广州市两株人感染H5N6禽流感病毒全基因组序列特征分析 |
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| 引用本文： | 曹蓝,李魁彪,刘艳慧,陆剑云,陈艺韵,苏文哲,鲁恩洁,夏丹,狄飚,张周斌.广州市两株人感染H5N6禽流感病毒全基因组序列特征分析[J].病毒学报,2020(4):588-599. |
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| 作者姓名： | 曹蓝 李魁彪 刘艳慧 陆剑云 陈艺韵 苏文哲 鲁恩洁 夏丹 狄飚 张周斌 |
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| 作者单位： | 广州市疾病预防控制中心 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金(项目号:2019A1515011510),题目:基于基因遗传多态性的禽流感传播风险研究；;广东省医学科研基金(项目号:A2018196),题目:疫苗选择压力下H7N9禽流感病毒遗传动力学研究；;广州市科技计划项目(项目号:201804010093),题目:不同休市策略对活禽市场禽流感病毒净化效果的研究~~； |
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| 摘 要： | H5N6禽流感是重要的人兽共患病,给公共卫生带来严重威胁。为研究人感染H5N6禽流感病毒的基因特征,本文对广州市两株人感染H5N6禽流感病毒进行全基因组序列扩增,应用生物信息学软件分析分子变异和遗传进化特征。结果显示:两毒株各基因片段同源性存在差异,血凝素(Hemagglutinin,HA)基因同源性最高为98.3%,PB2基因同源性最低为85.2%。A/Guangzhou/41641/2014(H5N6)病毒的HA、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)、聚合酶碱性蛋白2(Polymerase basic protein 2,PB2)基因与猫源毒株A/feline/Guangdong/1/2015(H5N6)亲缘关系较近,推测可能起源于共同祖先。两株病毒均为禽源高致病性病毒,HA和NA表面蛋白受体结合位点、裂解位点和耐药位点未发生变异。内部基因重要位点均有不同程度的变异,其中以41641病毒变异较大,并发生PB2蛋白E627K突变。两株病毒均发生与不同亚型病毒之间的重组现象,41641病毒的内部基因分别与H5和H9N2/H7N9发生重组,其中PB2和PB1基因分别与2013年...
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| 关 键 词： | H5N6禽流感 H7N9 基因重组 进化 回顾性研究 |
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