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| 鼻病毒A21基因型的划分及全基因组特征分析 | |
| 作者姓名： | 张强 张燕 胡满丽 谢智博 王慧玲 宋金华 许文波 |
| 作者单位： | 1. 安徽理工大学医学院;2. 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室(中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所)世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室;3. 中国科学院生物安全大科学研究中心 |
| 摘 要： | 人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013～2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前的研究已获得VP4/2区序列),结合从GenBank数据库下载的全球98株HRV-A21代表株,基于VP4/2区构建亲缘性关系树。本研究首次将HRV-A21划分为A、B、C、D、E五个基因型,其中E基因型进一步划分为E1、E2和E3亚型,并发现E1、E2和E3亚型在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。我国流行的HRV-A21以C和E基因型为主。基于VP1区划分基因型的结果与VP4/2区相似。本研究进而对这一株HRV-A21进行了全基因组序列测定,并结合GenBank数据库下载的HRV-A21全基因组序列,对HRV-A21进行基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。结果显示VP2区、VP3区、VP1区和3D区都属于高变区,但变异程度VP1区>VP2区>VP3区>3D区,同时发现了保守的14个N-糖基化位点... |
| 关 键 词： | 人鼻病毒A21型(HRV-A21) 基因型 基因特征 全基因组 分子流行病学 糖基化 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |