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玉米弯孢叶斑病菌clt-1基因生物信息学分析和启动子的功能鉴定
引用本文:倪璇,高金欣,余传金,刘铜,李雅乾,陈捷.玉米弯孢叶斑病菌clt-1基因生物信息学分析和启动子的功能鉴定[J].中国生物工程杂志,2017,37(3):37-42.
作者姓名:倪璇  高金欣  余传金  刘铜  李雅乾  陈捷
作者单位:1. 上海交通大学农业与生物学院 农业部都市农业(南方)重点开放实验室 上海 200240; 2. 上海交通大学 国家微生物代谢重点实验室 上海 200240
基金项目:国家自然科学基金(31471734),国家玉米产业技术体系(CARS-02)资助项目
摘    要:利用农杆菌介导的基因转化(Agrobacterium-mediated transformation,ATMT)技术构建玉米弯孢叶斑病菌突变体库,并从中筛选到了一个毒素合成相关基因clt-1。对clt-1基因编码的蛋白质进行生物信息学分析,结果表明CLT-1的分子质量为81.984 8k Da,等电点p I为8.62,不稳定指数为55.08;CLT-1是亲水性蛋白,包含1个膜外区域。在亚细胞水平上,CLT-1定位于细胞核内;在氨基酸序列方面,CLT-1含有多个苏氨酸、丝氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;在功能方面,CLT-1包含BTB特征结构域,可能参与一些功能蛋白质活性的调控。利用GFP(green fluorescent protein)基因作为报告基因,构建了用于鉴定clt-1基因启动子活性的p C1300th-Pclt1-GFP真菌表达载体,采用ATMT方法转化弯孢菌萌发的分生孢子,通过PCR及GFP荧光检测clt-1基因启动子在弯孢菌中调控GFP基因表达的活性。结果表明,在共聚焦激光扫描显微镜下观察到菌丝和孢子发绿色荧光,说明弯孢菌clt-1基因启动子具有较强驱动外源gfp基因表达的活性。

关 键 词:玉米弯孢叶斑病菌  生物信息学  clt-1  启动子活性  GFP  
收稿时间:2016-09-18

Bioinformatic Analysis and Promoter Identification of clt-1 Gene in Curvularia Lunata
NI Xuan,GAO Jin-xin,YU Chuan-jin,LIU Tong,LI Ya-qian,CHEN Jie.Bioinformatic Analysis and Promoter Identification of clt-1 Gene in Curvularia Lunata[J].China Biotechnology,2017,37(3):37-42.
Authors:NI Xuan  GAO Jin-xin  YU Chuan-jin  LIU Tong  LI Ya-qian  CHEN Jie
Abstract:
Keywords:Curvularia lunata  Promoter activity  GFP  Bioinformatic  clt-1  
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