| 肠道菌群核酸提取自动化流程的优化 |
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| 引用本文： | 李金蔓,裴广倩,范航,黄勇,童贻刚.肠道菌群核酸提取自动化流程的优化[J].中国生物工程杂志,2017,37(11):6-11. |
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| 作者姓名： | 李金蔓 裴广倩 范航 黄勇 童贻刚 |
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| 作者单位： | 1. 安徽医科大学 合肥 230032;2. 中国人民解放军军事科学院微生物与流行病研究所 北京 100071 |
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| 基金项目： | 病原微生物生物安全国家重点实验室课题资助项目（SKLPBS1518） |
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| 摘 要： | 目的:优化肠道菌群核酸提取自动化流程。方法:收集粪便样本,分别采用手工方法、核酸提取工作站提取核酸,然后利用液体工作站制备PCR反应液进行PCR扩增,最后采用文库工作站建库测序。结果:400μl样品用QIAamp~ Fast DNA Stool Mini Kit试剂盒裂解液裂解后,用MagMAX~(TM) Express 96机器提取核酸的方法与用QIAamp~ Fast DNA Stool Mini Kit试剂盒手工提取核酸的方法相比,测序得到的序列数基本一致,分析结果也没有明显区别;而单独采用MagMAX~(TM)Viral RNA Isolation Kit试剂盒提取核酸由于样品投入体积受限(50μl)、核酸浓度低、测序得到的序列数太少,不能满足后续的分析要求。结论:通过结合使用两种不同的试剂盒,可以实现核酸提取、PCR反应液配制及文库制备的全流程自动化操作,从而大大提高工作效率和结果的稳定性。
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| 关 键 词： | 自动化 肠道菌群 鸟枪法测序 |
| 收稿时间： | 2017-09-20 |
Optimization of Automatic Flow Chart for Nucleic Acid Extraction from Intestinal Microflora |
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| LI Jin-man,PEI Guang-qian,FAN Hang,HUANG Yong,TONG Yi-gang.Optimization of Automatic Flow Chart for Nucleic Acid Extraction from Intestinal Microflora[J].China Biotechnology,2017,37(11):6-11. |
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| Authors: | LI Jin-man PEI Guang-qian FAN Hang HUANG Yong TONG Yi-gang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Intestinal flora Shotgun sequencing Automation |
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