| 生物信息学辅助定位及延伸辐射诱导未知表达序列标签 |
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| 引用本文： | 罗瑛,隋建丽,铁轶,周平坤,孙志贤.生物信息学辅助定位及延伸辐射诱导未知表达序列标签[J].生物化学与生物物理进展,2001,28(2):188-191. |
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| 作者姓名： | 罗瑛 隋建丽 铁轶 周平坤 孙志贤 |
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| 作者单位： | 罗瑛（军事医学科学院放射医学研究所，北京
100850）
隋建丽（军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850）
铁轶（军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850）
周平坤（军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850）
孙志贤（军事医学科学院放射医学研究所，北京 100850） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(39870214) |
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| 摘 要： | 研究辐射诱导的基因表达调控对于认识细胞对辐射损伤的应激反应有重要意义.在低剂量辐射诱导新基因RIG1表达序列标签(expression
sequence tag,EST)片段的基础上，通过非克隆cDNA文库和RACE(rapidamplification
of cDNA end)技术获得了其3′末端.依据实验得到的这两段EST序列所提供的信息，通过生物信息学分析将RIG1基因初步定位在20号染色体.对20号染色体RIG1区基因组序列进行外显子扫描，发现预测的外显子正好与实验得到的EST相吻合.利用预测的外显子设计特异引物，成功地克隆了RIG1基因全长序列.同时，对20号染色体RIG1区的生物信息学分析表明，在RIG1基因的上游存在启动子区，从而确定了RIG1基因的基因组序列.因此，通过生物信息学辅助设计实验，快捷地定位及延伸了未知EST片段RIG1，基本完成了RIG1的全基因、基因组序列及染色体定位研究.
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| 关 键 词： | 辐射诱导基因，RIG1，外显子预测 |
| 收稿时间： | 2000/2/28 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2000年2月28日 |
Chromosome Location and Elongation of Radiation-induced Expressed Sequence Tag by the Aid of Bioinformatics |
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| LUO Ying,SUI Jian-Li,TIE Yi,ZHOU Ping-Kun and SUN Zhi-Xian.Chromosome Location and Elongation of Radiation-induced Expressed Sequence Tag by the Aid of Bioinformatics[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2001,28(2):188-191. |
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| Authors: | LUO Ying SUI Jian-Li TIE Yi ZHOU Ping-Kun and SUN Zhi-Xian |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | radiation induced gene RIG1 exon prediction |
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