| 中国野葡萄新基因cDNA全长的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 赵伟,徐伟荣,徐炎,贺明阳,王跃进. 中国野葡萄新基因cDNA全长的克隆及序列分析[J]. 西北植物学报, 2007, 27(5): 878-884 |
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| 作者姓名： | 赵伟 徐伟荣 徐炎 贺明阳 王跃进 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学,园艺学院,农业部西北园艺植物种质资源与遗传改良重点开放实验室,陕西杨陵,712100 |
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| 摘 要： | 根据对中国野生葡萄华东葡萄株系白河-35-1在白粉病诱导下构建的cDNA文库中获得的1条EST序列设计特异引物,以总RNA逆转录产物为模板,进行SMART-RACE扩增。结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,并预测了蛋白质的理化性质、信号肽、酶与非酶分析、亚细胞定位以及蛋白质二级结构。结果表明,获得的中国野生葡萄新基因的全长序列为854 bp,其开放阅读框为585 bp,5′非编码区为107 bp,3′非编码区为162 bp;同源性比对表明该新基因推导的氨基酸序列与拟南芥RNA结合蛋白和水稻推定的半乳糖基转移酶的同源性分别为55%和63%,第8~82位氨基酸序列与RNA识别基序相类似,是一个典型的结构功能域;推导该基因表达产物为相对分子质量为21 801.27、等电点为6.86的不稳定蛋白,定位于细胞核,不包含信号肽,二级结构主要是无规则卷曲。
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| 关 键 词： | 中国野生葡萄 cDNA全长 RACE基因克隆 生物信息学 |
| 文章编号： | 1000-4025（2007）05-0878-07 |
| 修稿时间： | 2006-09-05 |
Cloning Full Length cDNA of Chinese Wild Vitis Novel Gene and Sequence Analysis |
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| ZHAO Wei,XU Wei-rong,XU Yan,HE Ming-yang,WANG Yue-jin. Cloning Full Length cDNA of Chinese Wild Vitis Novel Gene and Sequence Analysis[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2007, 27(5): 878-884 |
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| Authors: | ZHAO Wei XU Wei-rong XU Yan HE Ming-yang WANG Yue-jin |
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| Affiliation: | College of Horticulture,Northwest A ~ F University,Key Laboratory of Horticulture Plant Germplasm and Genetic Improve- ment of China Agricultural Ministry,Yangling,Shaanxi 712100,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chinese wild grape cDNA full length RACE gene clone bioinformatics |
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