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兔出血症病毒遗传变异分析及RT—PCR检测方法的建立
作者姓名:刘月环  楼琦  金晓音  郭红刚  石巧娟
作者单位:浙江省医学科学院 浙江省实验动物中心 浙江省实验动物质量监督检测站,杭州310013
基金项目:浙江省科技厅实验动物平台项目(2007F80011).
摘    要:目的获得兔出血症病毒(浙江分离株)近20年间遗传变异概况,建立兔出血症病毒的RT—PCR检测方法。方法对1989~2006年间的7株RHDV浙江分离株的衣壳蛋白基因(VP60)进行了克隆与测序,并与国内、外RHDV的基因组序列进行了遗传比对和分析;根据兔出血症病毒株的VP60设计引物,对20只人工感染兔的实质脏器、全血和350只实验兔全血样本进行了检测。结果7株RHDV的VP60基因均由1740个核苷酸组成,编码580个氨基酸。它们与参考序列之间的氨基酸同源性为94.0%~99.8%。系统发生树分析结果显示,RHDV可划分为2个大的基因群,浙江(中国)的RHDV分离株主要集中于C亚群。RT—PCR检测方法表明20只实验兔全部扩出预期条带,而350只实验兔全血检测中出现13只RHDV可疑样本。经血凝抑制试验检测,13例PCR阳性样品中有10个HAI阳性,3个阴性。检测敏感度达100%,特异性为99.12%,经统计检验,kappa=0.865,表明PCR检出RHDV的结果与HAI高度一致。结论RHDV基因群之间的遗传距离有逐渐加大的趋势。我们建立的RT—PCR法可用于RHDV浙江分离株的检测,用RT—PCR检测全血中RHDV方法的建立为活体检测RHDV打下了基础。

关 键 词:兔病毒性出血症病毒  衣壳蛋白基因  遗传变异  RT—PCR
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