| 我国中部HIV-1 B'亚型分离株基因组结构特征及系统发育分析 |
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| 引用本文： | 冯福民,李敬云,鲍作义,庄道民,刘思杨,李林.我国中部HIV-1 B'亚型分离株基因组结构特征及系统发育分析[J].中国病毒学,2004,19(5):444-448. |
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| 作者姓名： | 冯福民 李敬云 鲍作义 庄道民 刘思杨 李林 |
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| 作者单位： | 军事医学科学院微生物流行病研究所,北京,100071 |
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| 摘 要： | 为了分析河南省Human immunodeficiency virus-1(HIV-1)流行株的基因特征和传染来源,我们从一位HIV-1感染的有偿献血员体内分离HIV-1毒株.提取感染细胞的全基因组DNA,扩增病毒全基因组,Walking法测得全长序列.与HIV-1 RL42和HIV-1 HXB2株比较,分析基因特征.用Anthewin软件比较分析CNHN24株和RL42株env蛋白的二级结构.用Clustal软件对国内HIV-1分离株和国际参考株的全基因组、env基因和V3环基因分别进行了系统发育分析.结果发现,CNHN24株为HIV-1 B'亚型,富含嘌呤,含量达到60.26%.与RL42株及HXB2株比较,pol基因和gag基因变异度较小,env基因及非结构基因变异度较大.与RL42株相比,env蛋白二级结构变异不大,但env保守区C4的氨基酸呈高度变异.系统发育分析显示,CNHN24株与RL42株遗传距离最近,HIV-1Lai株和HXB2株次之,与国内的HIV-1 B/C及AE/BC重组毒株的遗传距离较远;从V3序列的比较可以发现,CNHN24株与来自云南省的毒株HIV-1 CR206及RL42遗传距离最近.认为HIV-1 CNHN24株可能由云南传入.
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| 关 键 词： | Ⅰ型艾滋病病毒 基因组 系统发育分析 |
| 文章编号： | 1003-5125(2004)05-0444-05 |
| 修稿时间： | 2004年4月5日 |
Strutural Characterization and Phylogenetic Analysis of HIV-1 Genome of a Prevalent Subtype B' Strain in Central China |
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