军曹鱼MHC-Ⅱβ基因全长cDNA的克隆与组织表达分析 |
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引用本文: | 茅莉娜,冯娟,李玉谷,侯月娥,郭志勋,许海东.军曹鱼MHC-Ⅱβ基因全长cDNA的克隆与组织表达分析[J].动物学杂志,2010,45(4):118-128. |
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作者姓名: | 茅莉娜 冯娟 李玉谷 侯月娥 郭志勋 许海东 |
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作者单位: | 1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300;华南农业大学兽医学院,广州,510642 2. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300 3. 华南农业大学兽医学院,广州,510642 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 |
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摘 要: | 采用同源克隆和末端快速扩增(RACE)的方法,得到1161bp的军曹鱼(Rachycentron canadum)MHC-Ⅱβ全长cDNA片段。该序列包括20bp的5′末端非编码区(UTR),394bp的3′UTR及747bp的开放阅读框(ORF),编码248个氨基酸,预测其蛋白质分子量约为27.99ku,等电点为6.21。通过构建MHC-Ⅱβ氨基酸序列的系统进化树,并进行氨基酸相似性比对,结果表明,军曹鱼和已知鱼类、鼠(Musmusculus)、鸡(Gallus gallus)及人类(Homo sapiens)MHC-Ⅱβ氨基酸的同源性在28.5%~77.5%之间。所推测的蛋白序列具有一些重要的特征,包括:前导肽、β1、β2和CP/TM/CYT区,保守的半胱氨酸等。Real-time PCR检测结果显示,MHC-Ⅱβ基因在正常军曹鱼组织中均表达,但表达量在各个组织中不同,其中,头肾表达较强,鳃、脾、肠表达程度中等,在心、脑、肌肉中表达较弱。
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关 键 词: | 军曹鱼 MHC-Ⅱβ 全长cDNA 组织特异性表达 |
收稿时间: | 1/8/2010 12:00:00 AM |
修稿时间: | 2010/5/20 0:00:00 |
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