海三棱藨草及其近缘种的DNA条形码研究 |
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引用本文: | 张仕兰,王屿岑,刘文亮.海三棱藨草及其近缘种的DNA条形码研究[J].广西植物,2024(4):699-709. |
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作者姓名: | 张仕兰 王屿岑 刘文亮 |
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作者单位: | 1. 华东师范大学生态与环境科学学院,上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室;2. 崇明生态研究院 |
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基金项目: | 上海市自然科学基金(20ZR1416900); |
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摘 要: | 海三棱藨草×Bolboschoenoplectus mariqueter(Tang&F. T. Wang) Tatanov]的分类学地位至今尚无定论。为明确海三棱藨草的分类学地位并探讨其与近缘种的关系,该研究分别利用1个核基因(ITS)和5个叶绿体基因(matK、ndhF、rbcL、trnL和trnL-trnF)的DNA条形码序列对海三棱藨草及其近缘种的4种21批样品进行扩增和测序,通过采用相似性搜索算法对单一序列和序列组合的物种鉴定效率进行评价,并基于贝叶斯推断方法构建系统发育树进行鉴定分析。结果表明:(1)ITS+matK序列组合的物种鉴定效率最高,为71.4%,可实现海三棱藨草及其近缘种的种间区分、鉴定。(2)基于ITS+matK序列组合构建海三棱藨草及其近缘种的系统发育树,发现同一物种的样品聚集度较好,海三棱藨草与三棱草属Bolboschoenus(Asch.) Palla]的物种聚为一支,明显与水葱属Schoenoplectus(Rchb.) Palla]物种分开,并且海三棱藨草与海滨三棱草Bolboschoenus maritimus(Linnaeus) P...
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关 键 词: | 海三棱藨草 近缘种 DNA条形码 物种鉴定 亲缘关系 |
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