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百合属5种植物的比较转录组分析
引用本文:赵雪艳,李思锋,柏国清,李为民. 百合属5种植物的比较转录组分析[J]. 植物研究, 2021, 0(4)
作者姓名:赵雪艳  李思锋  柏国清  李为民
作者单位:陕西省西安植物园
基金项目:陕西省重点研发计划项目—农业领域(2018NY-88);陕西省科学院科技计划项目(2020K-28)。
摘    要:百合属植物是多年生的宿根草本植物,具有重要的观赏价值,有的种可食用也可药用。本研究对百合属4种植物(细叶百合、川百合、卷丹和百合)花的转录组进行测序,并结合前期的野百合的转录组数据进行比较转录组分析,鉴别花发育相关基因。并筛选出5种植物的直系同源基因,进而检测正选择基因,分析它们对环境的适应性。通过组装分别在细叶百合、川百合、卷丹以及百合花中获得了44565、51413、41638和44716个unigene。为了了解unigene功能信息,将其在公共数据库中进行比对和注释,发现了13个花发育相关基因。另外,在5个物种间共获得8247对直系同源基因,并计算其Ka、Ks及Ka/Ks值。在5个物种中有33对直系同源基因受到了强烈的正选择作用,随后对其进行GO、KEGG功能富集分析及基因功能注释,发现这些基因主要是与抗性以及生物合成相关的基因。

关 键 词:百合属  转录组  花发育基因  直系同源基因  正选择基因

Comparative Transcriptome Analysis of Five Species of Lilium
ZHAO Xue-Yan,LI Si-Feng,BAI Guo-Qing,LI Wei-Min. Comparative Transcriptome Analysis of Five Species of Lilium[J]. Bulletin of Botanical Research, 2021, 0(4)
Authors:ZHAO Xue-Yan  LI Si-Feng  BAI Guo-Qing  LI Wei-Min
Affiliation:(Shaanxi Engineering Research Centre for Conservation and Utilization of Botanical Resources,Xi’an Botanical Garden of Shaanxi Province,Institute of Botany of Shaanxi Province,Xi’an 710061)
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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