| 泡桐维管形成层及木质部区的转录组分析 |
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| 引用本文： | 滕云,邱宗波,王稳利,张雪如. 泡桐维管形成层及木质部区的转录组分析[J]. 植物研究, 2021, 0(3) |
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| 作者姓名： | 滕云 邱宗波 王稳利 张雪如 |
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| 作者单位： | 信阳农林学院园艺学院;河南师范大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31500499);河南省高校科技创新人才项目资助(16HASTIT019)。 |
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| 摘 要： | 采用Illumina HiSeqTM2500高通量测序技术,获得泡桐维管形成层及木质部区组织转录组的109021918条clean reads(16.35 Gb)。将clean reads从头组装得到104432个单基因簇(Unigene),平均长度662 nt。将组装得到的Unigenes与公共数据库进行序列比对,分别有40789(Nr:39.05%)、31675(NT:30.33%)、15539(COG:14.87%)、29168(GO:27.93%)、16316(KEGG:15.62%)、30499(SwissProt:29.20%)以及28828(Pfam:27.6%)个Unigenes获得功能注释。通过与GO数据库的比对分析,注释的29168个Unigenes归于生物过程、细胞组分及分子功能三大类的55个功能组;15539条Unigenes注释到COG数据库,被分为25个类别中;基于KEGG数据库可将16316个Unigenes归于130个代谢途径。此外,在泡桐的维管形成层及木质部区转录组中共检测出16118个简单序列重复(SSR)位点。为进一步挖掘泡桐重要功能基因提供了大量数据。
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| 关 键 词： | 泡桐 维管形成层 高通量测序 转录组 |
Transcriptome Analysis in Vascular Cambium and Xylem of Paulownia tomentosa |
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| TENG Yun,QIU Zong-Bo,WANG Wen-Li,ZHANG Xue-Ru. Transcriptome Analysis in Vascular Cambium and Xylem of Paulownia tomentosa[J]. Bulletin of Botanical Research, 2021, 0(3) |
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| Authors: | TENG Yun QIU Zong-Bo WANG Wen-Li ZHANG Xue-Ru |
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| Affiliation: | (College of Horticulture,Xinyang Agriculture and Forestry University,Xinyang 464000;College of Life Science,Henan Normal University,Xinxiang 453007) |
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