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广西南丹瑶鸡PGC-1α基因的克隆与生物信息学分析
摘    要:PGC-1α是影响脂肪沉积的重要候选基因,广西南丹瑶具有皮薄肉好的特点。因此,本研究的目的通过克隆和分析广西南丹瑶鸡PGC-1α基因全序列来阐述广西南丹瑶鸡优质肉品质形成的分子机理。根据Gen Bank上公布的参考序列(NM_001006457.1)设计引物,PCR扩增并克隆PGC-1α基因编码区全序列。结果显示,与参考序列(NM_001006457.1)相比,存在T~(51)C、T~(81)C、T~(90)C、C~(111)T、T~(465)C、G~(646)A、C~(741)T、C~(1572)G、T~(1579)G、T~(1720)C10处碱基突变,其中T~(51)C、T~(81)C、T~(90)C、C~(111)T、T~(465)C、C~(741)T、C~(1572)G 7处为同义突变,无氨酸改变。G~(646)A、T~(1579)G、T~(1720)C 3处为错义突变,分别造成天冬氨酸突变为天冬酰胺,丝氨酸突变为丙氨酸,丝氨酸突变为脯氨酸。同源性分析结果显示,广西南丹瑶鸡与家鸡、家鸽、小鼠、猪、人的同源性分别为99.62%、96.5%、83.7%、85.1%、85.9%。本研究的结果提示,广西南丹瑶鸡PGC-1α基因存在多处错义突变,这些突变可能是造成南丹瑶鸡优质的原因之一。

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