转录组测序揭示油桐脂肪酸的合成途径 |
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作者姓名: | 陈昊 蒋桂雄 龙洪旭 谭晓风 |
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作者单位: | [1]中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室,长沙410004 [2]中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,长沙410004 |
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基金项目: | 国家林业公益性行业科研专项重大项目(201204403). |
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摘 要: | 油桐是我国重要的木本油料植物,过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种,与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道。本研究采用转录组测序(RNA-Seq)技术,比较了油桐种子油脂合成3个不同时期的转录组,获得了大量差异表达的Unigene序列。通过GO(GeneOntology)分类和代谢途径富集性分析将这些差异表达的Unigene归类于包含脂肪酸生物合成途径在内的128个代谢途径。随后将脂肪酸生物合成途径中的54个Unigene序列在KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)数据库中进行比对,获得了14个关键酶的同源蛋白质。本研究通过对编码这些同源蛋白质的基因在油桐种子油脂合成期的表达模式进行分析,以期为油桐油脂合成,尤其是桐酸合成机理的解析提供理论参考,并为进一步的理论研究和油桐的遗传改良提供潜在的基因资源,从而提高油桐的单位面积产量。
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关 键 词: | 油桐(Vernicia Drdii) RNA Seq 转录组 脂肪酸生物合成 表达模式 |
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