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番茄NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析
引用本文:陈秀玲,王傲雪,张珍珠,李景富.番茄NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析[J].植物生理学通讯,2014(4):461-470.
作者姓名:陈秀玲  王傲雪  张珍珠  李景富
作者单位:[1]东北农业大学 园艺学院,哈尔滨150030 [2]东北农业大学 生命科学学院,哈尔滨150030
基金项目:国家自然基金项目(31301780)、黑龙江省教育厅海外学人项目(1252HQ011)、黑龙江省博士后基金(LBH-Z12044)和东北农业大学“寒地蔬菜生物学重点实验室”开放基金(CVB2012-05).
摘    要:NAC转录因子家族是植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育、器官建成及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用。本研究在基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的NAC转录因子家族成员、分布及结构和功能等进行分析。预测结果显示番茄NAC家族包含102个蛋白质,分为12亚族,其中茄属特有的TNAC亚族中成员最多,具有25个,其他NAC转录因子与拟南芥NAc家族具有相似分类。保守基序分析,在番茄NAC结构域中包含7个保守的NAM基序,主要分布在序列的N端,表明这些基序的存在对NAC蛋白质功能的执行是必需的。理化性质和结构分析表明,番茄NAC蛋白质绝大多数是亲水蛋白质,主要以无规则卷曲构成,而α-螺旋、β-折叠和β-转角则散布于整个蛋白质中,在各亚族中没有规律。

关 键 词:番茄  NAC转录因子  生物信息学

Genome-Wide Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Gene Family in Tomato
CHEN Xiu-Ling,WANG Ao-Xue,ZHANG Zhen-Zhu,LI Jing-Fu.Genome-Wide Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Gene Family in Tomato[J].Plant Physiology Communications,2014(4):461-470.
Authors:CHEN Xiu-Ling  WANG Ao-Xue  ZHANG Zhen-Zhu  LI Jing-Fu
Institution:1School of Horticulture, 2School of Life Science, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China)
Abstract:
Keywords:
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