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谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析
引用本文:刘宝玲,张莉,孙岩,薛金爱,高昌勇,苑丽霞,王计平,贾小云,李润植.谷子bZIP转录因子的全基因组鉴定及其在干旱和盐胁迫下的表达分析[J].植物学报,2016,51(4):473-487.
作者姓名:刘宝玲  张莉  孙岩  薛金爱  高昌勇  苑丽霞  王计平  贾小云  李润植
作者单位:1山西农业大学分子农业与生物能源研究所, 太谷 0308012山西农业大学生命科学学院, 太谷 030801
基金项目:国家948项目(No.2014-Z39)、山西省煤基重点科技攻关项目(No.FT-2014-01)、山西省回国留学人员科研基金(No.2015-064)和国家自然科学基金(No.31401430, No.31201266, No.31501323)
摘    要:bZIP蛋白是植物转录因子中最大和最保守的一类转录因子, 参与调控植物生长发育等多种生命活动。谷子(Setaria italica)是一种重要的C4杂粮作物, 其bZIP基因家族与功能报道较少。利用生物信息学工具, 从谷子全基因组中鉴定出73个SibZIP转录因子, 划分为A、B、C、D、E、G、H、I和X等亚家族。与已测序的禾谷类作物相比, 谷子SibZIP基因家族在进化中发生缩减。在谷子SibZIP蛋白中检测到25种不同的保守氨基酸基序。RNA-seq和定量PCR检测结果表明, 在干旱和盐胁迫条件下, 多数SibZIPs基因不同程度地被诱导表达, 预示着部分SibZIP成员在谷子干旱和盐胁迫响应中起重要作用。共表达关联性分析进一步揭示19个谷子SibZIP转录因子可通过与蛋白激酶或NPR1相关调节蛋白等互作介导谷子胁迫响应。研究结果为全面解析谷子SibZIPs基因结构与生物学功能、抗旱分子机制以及分子育种提供了新信息。

收稿时间:2015-08-18
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