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草莓YABBY基因家族的鉴定及表达分析
作者姓名:余婷婷  沈淑容  许以灵  王欣雨  余瑶  马伯军  陈析丰
作者单位:浙江师范大学生命科学学院, 浙江 金华 321004
基金项目:国家自然科学基金(32071987);浙江省自然科学基金(LZ23C130004)
摘    要:YABBY蛋白是一类调控植物形态建成与器官发育的重要转录因子。为了研究草莓YABBY,通过生物信息学技术鉴定了森林草莓(二倍体)与栽培草莓(八倍体)的YABBY基因家族成员及其序列特征,构建了各成员与植物YABBY的系统发育树与共线性关系图,并利用RNA-seq数据与定量逆转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, qRT-PCR)技术分析其表达模式,构建绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP)融合表达载体,在烟草叶细胞中瞬时表达观察其亚细胞定位。研究结果表明,森林草莓有6个FvYABBY基因,栽培草莓有26个FxaYABBY基因;FvYABBY基因家族成员可归为5个不同的进化分支,与拟南芥AtYABBY基因家族存在5对直系同源。在森林草莓中,所有FvYABBY在根和花托中基本不表达,FvYABBY1FvYABBY2FvYABBY5FvYABBY6在叶、茎、花和瘦果中高表达;在栽培草莓中,FxaYABBY1FxaYABBY2FxaYABBY5FxaYABBY6在瘦果中表达,所有FxaYABBY在花托中为低表达或不表达。此外,在低温、高盐和干旱等非生物胁迫下,FvYABBY1FvYABBY3FvYABBY4FvYABBY6下调表达,FvYABBY5上调表达,FvYABBY2则先上调后下调表达。在烟草叶细胞中,所有FvYABBY蛋白均定位在细胞核。以上结果为草莓YABBY基因的后续功能研究奠定了基础。

关 键 词:草莓  YABBY基因家族  序列分析  表达模式  亚细胞定位
收稿时间:2023-02-18
修稿时间:2023-05-04
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