基于RNA-seq探究东方水韭对高原环境潜在的适应性 |
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引用本文: | 邵静静,刘泰龙,张文才,刘星.基于RNA-seq探究东方水韭对高原环境潜在的适应性[J].植物科学学报,2023(1):70-78. |
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作者姓名: | 邵静静 刘泰龙 张文才 刘星 |
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作者单位: | 1. 武汉大学生命科学学院植物系统学与进化生物学实验室;2. 西藏大学理学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31170203)~~; |
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摘 要: | 本研究以移栽到不同海拔地区的东方水韭(Isoetes orientalis Liu Hong)为材料,利用转录组测序技术分析基因表达情况,探究其在不同海拔条件下水生和陆生环境中的适应机制。结果显示,与低海拔相比,移栽到高海拔的植株中存在较多的差异表达基因,显著富集在磷酸肌醇代谢、光合作用、天线蛋白、黄酮类化合物和苯丙素生物合成的通路中,特别是移栽到西藏的植株中存在许多特异性表达的基因,这些基因大多注释为核糖体蛋白、DNA损伤修复酶和不饱和脂肪酸生物合成相关的酶。而这种基因表达模式可能与植物适应高海拔、低氧强辐射、温度变化剧烈的环境相关。研究结果也表明,长期生长在低海拔的东方水韭可以在高海拔环境中生存,而且基因表达模式方面存在一定规律。
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关 键 词: | 东方水韭 转录组 海拔梯度 环境压力 适应性 |
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