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多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析
引用本文:刘晓妹,蒲金基,张欣,漆艳香,谢艺贤,张贺,郑服丛.多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析[J].生物技术通报,2012(10).
作者姓名:刘晓妹  蒲金基  张欣  漆艳香  谢艺贤  张贺  郑服丛
作者单位:1. 海南大学环境与植物保护学院,海口570228;海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室,海口570228
2. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,儋州,571737
3. 海南大学环境与植物保护学院,海口,570228
基金项目:科技部科技支撑计划项目,国家橡胶产业技术体系
摘    要:采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA.生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI) 6.43.从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域.推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等.

关 键 词:多主棒孢菌  蛋白激酶  克隆  生物学信息

Cloning and Bioinformatics Analysis of Gene CCK1 Related to Pathogenicity of Corynespora cassiicola on Hevea Rubber
Liu Xiaomei , Pu Jinji , Zhang Xin , Qi Yanxiang , Xie Yixian , Zhang He , Zheng Fucong.Cloning and Bioinformatics Analysis of Gene CCK1 Related to Pathogenicity of Corynespora cassiicola on Hevea Rubber[J].Biotechnology Bulletin,2012(10).
Authors:Liu Xiaomei  Pu Jinji  Zhang Xin  Qi Yanxiang  Xie Yixian  Zhang He  Zheng Fucong
Abstract:
Keywords:
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