| 盐穗木miR166a前体和预测靶基因ATHB8-like的克隆及二者靶向关系的鉴定 |
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| 引用本文： | 张素伟,易小娅,曾幼玲. 盐穗木miR166a前体和预测靶基因ATHB8-like的克隆及二者靶向关系的鉴定[J]. 西北植物学报, 2017, 37(6): 1073-1079 |
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| 作者姓名： | 张素伟 易小娅 曾幼玲 |
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| 作者单位： | （新疆大学 生命科学与技术学院，新疆生物资源基因工程重点实验室，乌鲁木齐 830046） |
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| 基金项目： | 新疆自治区自然科学基金（2015211C274） |
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| 摘 要： | 以盐生植物盐穗木为实验材料,从前期构建的高盐胁迫下盐穗木根的小RNA文库中候选了差异表达的miR166a,利用生物信息学从盐穗木转录组数据中预测其靶基因;采用5′RLM-RACE技术鉴定盐穗木miR166a对预测靶基因ATHB8-like的靶向性;通过PCR和RACE技术克隆盐穗木miR166a前体和预测靶基因ATHB8-like全长基因序列,并进行相应的生物信息学分析。结果显示:盐穗木miR166a预测的靶基因为ATHB8-like;通过实验鉴定确实存在靶向切割,具体的切割位点位于miR166a成熟体的14~15碱基之间;miR166a成熟体序列在不同植物中高度保守;克隆获得的盐穗木miR166a前体可折叠成完整的颈环结构,符合miRNA的前体特征,候选植物miR166a前体在进化上没有表现出保守性;预测的靶基因ATHB8-like cDNA全长为2 786bp,开放阅读框为2 526bp,编码841个氨基酸,ATHB8-like具有一个HD-ZIPⅢ结构域,在进化上具有保守性。该研究结果为进一步开展盐穗木miR166a和ATHB8-like的生物学功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 盐穗木；miR166a；ATHB8 like；靶向关系；克隆 |
Clone and Correlation Identification of Halostachys caspica miR166a Precursor and Its Predicted Target ATHB8 like |
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| ZHANG Suwei,YI Xiaoy,ZENG Youling. Clone and Correlation Identification of Halostachys caspica miR166a Precursor and Its Predicted Target ATHB8 like[J]. Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica, 2017, 37(6): 1073-1079 |
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| Authors: | ZHANG Suwei YI Xiaoy ZENG Youling |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Halostachys caspica miR166a AHTB8 like correlation clone |
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