用作交联剂的甲醛可改变细胞蛋白质谱

甲醛能可逆性地交联蛋白质或DNA分子,因此被广泛应用于鉴定生物大分子复合物中的蛋白质或DNA。一般认为,甲醛分子小,可快速进入细胞,且作为交联剂使用时浓度较高,因而能在细胞做出应激反应之前将蛋白质和DNA交联固定在自然状态下。但高浓度甲醛是否能在交联固定生物大分子之前改变细胞蛋白质水平,尚无相关研究。如果属实,则可能导致相关研究产生假阳性或假阴性的结果。作者运用蛋白质组学技术分析对比了经过高浓度甲醛和未经甲醛处理过的Jurkat细胞的蛋白质谱。结果表明,高浓度甲醛可导致多个蛋白质水平产生差异。因此,将甲醛作为交联试剂使用时,应考虑设置甲醛处理的样本作为对照,或者增加实验重复次数,以避免鉴定到假阳性或假阴性的蛋白质或DNA。