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我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3′端序列的变异
引用本文:陈炯,郑红英,陈剑平,杨崇良.我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3′端序列的变异[J].中国科学C辑,2002,32(3):225-231.
作者姓名:陈炯  郑红英  陈剑平  杨崇良
作者单位:1. 浙江大学生命科学学院,杭州,310029;浙江省农业科学院病毒室,杭州,310021
2. 华中农业大学植物保护系,武汉,430070
3. 浙江省农业科学院病毒室,杭州,310021
4. 山东省农业科学院植物保护研究所,济南,250100
基金项目:浙江省重点实验室专项基金资助项目(批准号: 001107557)、青年人才专项基金资助项目(批准号: RC9604)和浙江省科技重大攻关资助项目(批准号: 011102181)
摘    要:从我国6个省市12个大蒜样品上共检出10个不同的香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)分离物, 测定了浙江分离物ZJ1的基因组全序列和其他9个分离物的基因组3′端序列. ZJ1分离物RNA基因组全长8363个核苷酸, 3′端具polyA尾, 含6个可读 框(ORF), 分别编码复制酶, TGB1, TGB2, TGB3, CP和NABP, 基因组结构和其他Carlavirus属成员相似. 序列分析表明, 10个分离物均为大蒜潜隐病毒(GarLV), 不同分离物TGB2, TGB3和NABP的差异大于CP的差异, 且这些分离物和葱潜隐病毒(ShLV)也具有很高的同源性. 系统进化树分析表明, 大蒜来源的GarLV分离物可以分成4个类群, 我国分离物分别属于4个不同类群.

关 键 词:核苷酸序列  基因组结构  变异  大蒜潜隐病毒
收稿时间:2001-07-06
修稿时间:2001年7月6日
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