| 基于TCGA和GEO数据库的胃癌lncRNA筛选与ceRNA网络构建 |
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| 引用本文： | 雍嘉欣,韦权峰,刘尚辉. 基于TCGA和GEO数据库的胃癌lncRNA筛选与ceRNA网络构建[J]. 生物技术进展, 2022, 12(1): 149-157. DOI: 10.19586/j.2095-2341.2021.0042 |
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| 作者姓名： | 雍嘉欣 韦权峰 刘尚辉 |
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| 作者单位： | 1.中国医科大学第二临床学院，沈阳 110122;2.中国医科大学第一临床学院，沈阳 110122;3.中国医科大学智能医学学院，沈阳 110122 |
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| 基金项目： | 2020年中国医科大学大学生创新创业训练计划(国家级)项目(202010159006)。 |
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| 摘 要： | 胃癌(gastric cancer,GC)是我国最常见的恶性肿瘤之一,严重危害人类健康。胃癌发病机制复杂,缺乏特异性预后生物标志物。长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)可作为竞争性内源RNA (competing endogenous RNA,ceRNA),影响microRNA (miRNA)与mRNA的结合,从而影响胃癌的发生、发展。基于TCGA和GEO数据库的转录组数据,筛选GC 中差异表达的 lncRNAs,并构建基于 6 条 lncRNAs(HAGLROS、TMEM92-AS1、LINC01745、HOXC-AS3、SEMA3B-AS1、FEZF1-AS 1)的lncRNA-miRNA-mRNA网络。网络核心基因的KEGG/GO富集和蛋白质互作分析结果显示,lncRNA可能通过miRNA海绵吸附作用,调控胃癌的发生、发展与转移。AC011352.1、AC087636.1、AC093627.1、GAS1RR与胃癌患者的预后相关性具有统计学意义(P<0.05),并可能成为胃癌患者潜在的预后生物标志物。
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| 关 键 词： | 胃癌 长链非编码RNA 竞争性内源RNA网络 预后生物标志物 |
| 收稿时间： | 2021-04-02 |
Expression Profile Screening of lncRNA and ceRNA Network Construction in Gastric Cancer Based on TCGA and GEO Databases |
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| YONG Jiaxin,WEI Quanfeng,LIU Shanghui. Expression Profile Screening of lncRNA and ceRNA Network Construction in Gastric Cancer Based on TCGA and GEO Databases[J]. CURRENT BIOTECHNOLOGY, 2022, 12(1): 149-157. DOI: 10.19586/j.2095-2341.2021.0042 |
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| Authors: | YONG Jiaxin WEI Quanfeng LIU Shanghui |
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| Affiliation: | 1.Second Clinical College，China Medical University，Shenyang 110122，China;2.First Clinical College，China Medical University，Shenyang 110122，China;3.School of Intelligent Medicine，China Medical University Shenyang 110122，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | gastric cancer long non-coding RNA competing endogenous RNA network prognostic biomarkers |
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