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檀香NDH脱氢酶基因的克隆、定位与启动子分析
引用本文:闫海锋,吕金凤,熊发前,丘立杭,周慧文,陈兴隆,马国华.檀香NDH脱氢酶基因的克隆、定位与启动子分析[J].广西植物,2024,44(5):951-960.
作者姓名:闫海锋  吕金凤  熊发前  丘立杭  周慧文  陈兴隆  马国华
作者单位:1. 广西壮族自治区农业科学院 甘蔗研究所, 南宁 530007; 2. 农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室, 南宁 530007; 3. 广西甘蔗遗传改良重点实验室, 南宁 530007; 4. 广西林业集团桂钦林浆纸有限公司, 南宁 530012; 5. 广西大学 农学院, 南宁 530004; 6. 中国科学院华南植物园, 广州 510650
基金项目:国家自然科学基金(32060358); 广东省重点科技项目(2015B020231008); 广西自然科学基金(2019GXNSFAA185005)。
摘    要:为研究檀香NDH脱氢酶基因的功能和调控机制,该文以檀香心材为材料,利用RACE技术克隆SaNDH6基因的全长序列,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析其组织和激素处理后的表达模式,在拟南芥原生质体观测其亚细胞定位,利用PlantCARE分析SaNDH6起始密码子ATG上游2 kb的启动子序列,同时运用PlantRegMap预测可能与其结合的转录因子。结果表明:(1)SaNDH6编码303个氨基酸,为疏水蛋白,亚细胞定位于叶绿体。(2)进化树分析表明,檀香SaNDH6与木本植物NDH6进化关系较近。(3)PlantCARE分析发现,SaNDH6启动子中除含有ACE、AE-box、Box 4、G-Box和GT1-motif等大量光响应元件外,同时还有茉莉酸甲酯(MeJA)反应元件CGTCA-motif和TGACG-motif,赤霉素(GA3)响应元件P-box,以及防御和胁迫响应元件TC-rich repeats等。(4)PlantRegMap分析发现,有76个转录因子可能与SaNDH6启动子结合,其中ERF家族最多,达40个。(5)SaNDH6在檀香的根、心材、叶片和愈伤组织中均有表达,其中在叶片中的表达量较高; 用1×10-4 mol·L-1的MeJA和GA3分别处理檀香愈伤组织后,与处理前(0 h)相比,SaNDH6的表达均在3 h后显著升高。综上结果表明,檀香SaNDH6为核基因编码的蛋白,受光和激素等诱导表达,SaNDH6可能参与檀香逆境胁迫反应的过程。

关 键 词:檀香    叶绿体    NDH脱氢酶    亚细胞定位    表达调控
收稿时间:2023/7/27 0:00:00
修稿时间:2023/8/25 0:00:00

Molecular cloning, location and promoter analysis of NDH dehydrogenase gene from Santalum album
YAN Haifeng,L&#; Jinfeng,XIONG Faqian,QIU Lihang,ZHOU Huiwen,CHEN Xinglong,MA Guohua.Molecular cloning, location and promoter analysis of NDH dehydrogenase gene from Santalum album[J].Guihaia,2024,44(5):951-960.
Authors:YAN Haifeng  L&#; Jinfeng  XIONG Faqian  QIU Lihang  ZHOU Huiwen  CHEN Xinglong  MA Guohua
Institution:1. Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China; 2. Key Laboratory of Sugarcane Biotechnology and Genetic Improvement, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Nanning 530007, China; 3. Key Laboratory of Guangxi Sugarcane Genetic Improvement, Nanning 530007, China; 4. Guangxi Forestry Group Guiqinlin Pulp Paper Co. Ltd., Nanning 530012, China; 5. Agriculture College of Guangxi University, Nanning 530004, China; 6. South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510650, China
Abstract:
Keywords:Santalum album  chloroplast  NDH dehydrogenase  subcellular location  expression regulation
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