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甘蔗黑穗病菌RNA干扰相关基因ssdcl的功能研究
引用本文:蔡晓薇,余梅,何媛媛,陈保善,李茹.甘蔗黑穗病菌RNA干扰相关基因ssdcl的功能研究[J].基因组学与应用生物学,2020,39(3):1113-1119.
作者姓名:蔡晓薇  余梅  何媛媛  陈保善  李茹
作者单位:广西大学生命科学与技术学院,南宁,530004;广西大学生命科学与技术学院,南宁,530004;亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁,530004
基金项目:广西自然科学基金;国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)是典型的二型态真菌,由其引起的甘蔗黑穗病是一个全球性的病害,对甘蔗产量和含糖量造成巨大损失。RNA干扰是一种保守的小RNA介导的转录后基因沉默机制。目前甘蔗黑穗病菌的RNA干扰系统尚未明确。本研究用蛋白保守结构域对甘蔗黑穗病菌基因组进行搜索,发现了一个RNA干扰组件DICER-LIKE (SsDcl)蛋白。序列分析显示此蛋白具有剪切双链RNA所必需的RNaseⅢ结构域和双链RNA识别区域。为了研究ssdcl基因的功能,本研究以甘蔗黑穗病菌单倍体JG36为出发菌株,构建了ssdcl基因的缺失突变株。与野生型相比,Δssdcl突变体的生长速度较慢,与野生型JG35配合后形成的二倍体菌丝更为细小,且分支较多,表明ssdcl基因的缺失可能影响了黑穗病菌菌丝的生长发育过程。另外,Northern blot和qRT-PCR的结果显示,ssdcl基因缺失突变体中milR-4的表达量下调,提示ssdcl基因在甘蔗黑穗病菌milRNAs形成过程中起重要作用。

关 键 词:甘蔗黑穗病菌  RNA干扰  ssdcl基因

Functional Study of ssdcl Gene involving in RNA Interference in Sporisorium scitamineum
Cai Xiaowei,Yu Mei,He Yuanyuan,Chen Baoshan,Li Ru.Functional Study of ssdcl Gene involving in RNA Interference in Sporisorium scitamineum[J].Genomics and Applied Biology,2020,39(3):1113-1119.
Authors:Cai Xiaowei  Yu Mei  He Yuanyuan  Chen Baoshan  Li Ru
Institution:(College of Life Science and Technology,Guangxi University,Nanning,530004;State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources,Nanning,530004)
Abstract:
Keywords:Sporisorium scitamineum  RNA interference  ssdcl
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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