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黄檗根围丛枝菌根真菌菌群组成
引用本文:蔡柏岩 葛菁萍 接伟光 阎秀峰. 黄檗根围丛枝菌根真菌菌群组成[J]. 菌物学报, 2009, 28(4): 512-520
作者姓名:蔡柏岩 葛菁萍 接伟光 阎秀峰
作者单位:黑龙江大学生命科学学院,黑龙江省普通高等学校微生物重点实验室,哈尔滨,150080;黑龙江东方学院食品与环境工程学部,哈尔滨,150086;黑龙江大学生命科学学院,黑龙江省普通高等学校微生物重点实验室,哈尔滨,150080;黑龙江东方学院食品与环境工程学部,哈尔滨,150086;东北林业大学生命科学学院,哈尔滨,150040
基金项目:黑龙江省博士后启动基金,黑龙江大学博士启动基金 
摘    要:从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendron amurense根系及根围土壤,采用Nested-PCR技术扩增黄檗菌根及根围土壤AM真菌18S rDNA NS31/Glol区域,利用该产物进行DGGE分析,并结合DNA测序、系统发育分析及DGGE图谱分析技术对黄檗AM真菌菌群组成进行分析.结果表明:Nested-PCR技术具有较高的灵敏性,可有效地从微量DNA中扩增出约230bp的目的片段;黄檗根系及根围土壤具有不同的DGGE指纹图谱特征,DGGE带谱在条带的数量、亮度、优势度等方面均存在较大差异,全部序列可分为3类菌群,即球囊霉属Glomus、盾孢囊霉属Scutellospora及植物病原菌黄杨亚赤壳Hyponectria buxi,其中Glomus sp.(EF177624)和Glomus sp.(DQ085205)分别为黄檗根系和根围土壤样品中最具优势的AM真菌.

关 键 词:18S rDNA  Nested-PCR技术  变性梯度凝胶电泳  系统发育分析

The community composition of the arbuscular mycorrhizal fungi in the rhizosphere of Phellodendron amurense
CAI Bai-Yan GE Jing-Ping JIE Wei-Guang YAN Xiu-Feng. The community composition of the arbuscular mycorrhizal fungi in the rhizosphere of Phellodendron amurense[J]. Mycosystema, 2009, 28(4): 512-520
Authors:CAI Bai-Yan GE Jing-Ping JIE Wei-Guang YAN Xiu-Feng
Affiliation:Key Laboratory of Microbiology, College of Life Sciences, Heilongjiang University, Harbin 150080, China
Abstract:The rhizospheric soil and root samples of Phellodendron amurense were collected in the Logging Station of Northeast Forestry University.Nested-PCR was conducted to specifically amplify NS31/Glol domain sequences of the small-subunit(18S) rDNA from the AM fungi in the root and rhizospheric soil samples of P.amurense,respectively.The Nested-PCR products were applied to denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE) analysis.Then,the community composition of the AM fungi was analyzed by DGGE,sequencing,and phyl...
Keywords:18S rDNA  18S rDNA  Nested-PCR  denaturing gradient gel electrophoresis  phylogenetic analysis
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