| 尿路致病性大肠杆菌中Ⅰ型限制-修饰系统C5423-5425的鉴定 |
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| 引用本文： | 李火明,夏颖,李干武,蔡文通.尿路致病性大肠杆菌中Ⅰ型限制-修饰系统C5423-5425的鉴定[J].微生物学报,2021,61(8):2457-2468. |
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| 作者姓名： | 李火明 夏颖 李干武 蔡文通 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所, 兽医生物技术国家重点实验室, 黑龙江哈尔滨 150069 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31902242）；国家重点研发计划（2018YFD0500500） |
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| 摘 要： | 目的] 多方面鉴定尿路致病性大肠杆菌中的Ⅰ型限制-修饰（restriction-modification，RM）系统C5423-5425，并揭示其功能与生理意义。方法] 利用Lambda Red重组系统构建CFT073 DNA甲基化转移酶基因缺失株Δc5424；利用单分子实时测序分析以获得C5424甲基化修饰的位点与基序；利用转化效率试验说明RM系统抵御外源DNA的转化；利用转录组测序和荧光定量RT-PCR鉴定C5424的调控基因；利用软琼脂平板运动试验等方法研究细菌生理功能的变化。结果] 用生物信息学方法鉴定了一个Ⅰ型RM系统；获得了c5424的突变株；鉴定了C5424修饰的靶序列GmAGNNNNNNNGTCA/TGmAC NNNNNNNCTC，并揭示了靶序列在基因组中的分布；C5424系统可以抵御外源DNA的进入；c5424的缺失显著影响17个基因的表达，包括运动相关基因motB和抗活性氯基因rclR等；c5424的缺失显著影响CFT073的运动能力和抗次氯酸的能力。结论] 本文从多方面鉴定了尿路致病性大肠杆菌CFT073中的I型RM系统C5423-5425，这个系统对细菌具有重要的生理意义。本文对研究细菌的表观遗传学具有参考价值。
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| 关 键 词： | 尿路致病性大肠杆菌 DNA甲基化转移酶 单分子实时测序 限制-修饰系统 |
| 收稿时间： | 2020/9/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/1/14 0:00:00 |
Characterization of a type I restriction-modification system C5423-5425 in uropathogenic Escherichia coli |
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| Huoming Li,Ying Xi,Ganwu Li,Wentong Cai.Characterization of a type I restriction-modification system C5423-5425 in uropathogenic Escherichia coli[J].Acta Microbiologica Sinica,2021,61(8):2457-2468. |
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| Authors: | Huoming Li Ying Xi Ganwu Li Wentong Cai |
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| Institution: | State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150069, Heilongjiang Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | uropathogenic Escherichia coli DNA methyltransferase single molecule real-time sequencing restriction-modification system |
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