白鱀豚MHC基因类DQB1座位第二外元的序列变异分析 |
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引用本文: | 严洁,杨光,周开亚,魏辅文.白鱀豚MHC基因类DQB1座位第二外元的序列变异分析[J].动物学报,2003,49(4):501-507. |
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作者姓名: | 严洁 杨光 周开亚 魏辅文 |
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作者单位: | 南京师范大学生命科学学院遗传资源研究所 南京210097
(严洁,杨光,周开亚),中国科学院动物研究所 北京100080(魏辅文) |
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基金项目: | 国家自然科学基金 (No .3 0 2 70 2 12和No .3 0 0 70 116),国家杰出青年科学基金 (No.3 0 12 5 0 0 6),国家“2 11工程”“十五”建设项目,江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人科研基金资助~~ |
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摘 要: | 测定了 4 5个克隆的白豚 (Lipotesvexillifer)MHCⅡ类基因DQB座位第二外元 172bp的核苷酸序列 ,共获得 15种序列 ,发现了 2 2个变异位点。核苷酸的非同义替换明显多于同义替换 ,并造成了 15个氨基酸的改变。氨基酸的替换趋于集中在假定的与抗原的选择性识别相关的位点附近。白豚DQB基因的核苷酸和氨基酸序列与文献报道的白鲸 (Delphinapterusleucas)和一角鲸 (Monodonmonoceros)DQB1序列具有较高的同源性。氨基酸序列不具备人及其它一些灵长类动物DQB2基因所共有的基序 (Motif) ,而与牛DQB1基因的基序相近 ,说明本研究得到的白豚MHC序列应属于类DQB1基因。同一个体出现了多种序列的情况 ,提示白豚的DQB基因可能存在着座位重复。白豚的类DQB1座位的序列中存在多种基序的不同组合 ,推测是由于基因转换造成的.
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关 键 词: | 白鱀豚 MHC 类DQB1(DQB1like)座位 基因重复 基因转换 |
Sequence variation at exon 2 of the major histocompatibility complex DQB1-like locus in the Baiji (Lipotes vexillifer) |
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Abstract: | |
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Keywords: | Baiji(Lipotes vexillifer) MHC DQB1-like locus Gene duplication Gene conversion |
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