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竞争性RT-PCR法及对大肠杆菌acrA基因mRNA表达水平的定量研究
引用本文:陈爱美,陈仪本.竞争性RT-PCR法及对大肠杆菌acrA基因mRNA表达水平的定量研究[J].微生物学报,2007,47(2).
作者姓名:陈爱美  陈仪本
作者单位:1. 广东省微生物研究所,广州,510070;中国科学院南海海洋研究所,广州,510301;广东省菌种保藏与应用重点实验室,广州,510070
2. 广东省微生物研究所,广州,510070
基金项目:广东省科技攻关计划;广东省科学院科研基金
摘    要:建立了用于检测大肠杆菌(Escherichia coli)ATCC25922的acrA基因mRNA表达水平的定量竞争性RT-PCR(QC-RT-PCR)体系。PCR合成目标片段的突变型片段(321bp)作为内标准模板(Internal standard,IS),与目标片段一致的片段(389bp)作为目标模板(Target standard,TS),优化两种模板共扩增体系;梯度稀释IS与等量大肠杆菌cDNA样本共扩增,扫描电泳条带,软件分析数据。结果表明,引物设计合适,以IS和TS为模板实现共扩增,产物(321bp和389bp)通过1.5%琼脂糖凝胶电泳有效分离;梯度稀释IS与cDNA共扩增产物出现亮度梯度电泳条带;获得一元回归曲线y=-0.345 0.097x(相关系数r=0.959,标准差s=0.05997)。该研究成功构建内标准模板,优化的共扩增PCR体系实现了对大肠杆菌ATCC25922中acrA基因mRNA表达水平的检测,具有简便、高效、敏感度高等优点。

关 键 词:定量竞争性RT-PCR  外排系统

Quantitative competitive RT-PCR and quantitative detection of Escheriia coli acrA -mRNA
CHEN Ai-mei,CHEN Yi-ben.Quantitative competitive RT-PCR and quantitative detection of Escheriia coli acrA -mRNA[J].Acta Microbiologica Sinica,2007,47(2).
Authors:CHEN Ai-mei  CHEN Yi-ben
Abstract:
Keywords:acrA
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