鉴定水稻中一个新的专一结合GCC元件的AP2/EREBP族转录因子 |
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引用本文: | 陈峰,余军平,方晓红,张贵友.鉴定水稻中一个新的专一结合GCC元件的AP2/EREBP族转录因子[J].生物化学与生物物理进展,2006,33(7):627-634. |
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作者姓名: | 陈峰 余军平 方晓红 张贵友 |
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作者单位: | 1. 清华大学生物科学与技术系,北京,100084 2. 中国科学院化学研究所,北京,100080 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(39970166,20225516和10334100)~~ |
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摘 要: | TSH1,是通过搜寻GenBank的EST库而获得的一个来源于水稻的含AP2/EREBP保守结构域的蛋白质.为了详细分析TSH1蛋白与其DNA顺式元件的结合特性,首先采用传统的凝胶阻滞实验和酵母单杂交技术,证实TSH1在体内和体外均专一性地结合于GCC元件,然后利用原子力显微镜技术精确测量了TSH1蛋白与GCC元件在单分子水平的相互作用力.结果表明,GST-TSH1与DRE元件没有特异性的结合,而GST-TSH1与GCC元件结合力的大小为(83.9±2.2)pN,这种特异性的结合可以被加入的游离TSH1蛋白明显降低.GST蛋白和突变GCC元件作为负对照显示出与GCC元件无特异性作用力.以上结果充分证明,TSH1是专一性地与GCC元件相作用的转录因子,而且原子力显微镜对于检测转录因子与DNA相互作用时单碱基的突变十分灵敏.通过比较几种评估转录因子与DNA顺式元件结合特异性的方法,阐述了原子力显微镜技术的特点及优越性.
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关 键 词: | TSH1 AP2/EREBP 转录因子 原子力显微镜 |
收稿时间: | 04 27 2006 12:00AM |
修稿时间: | 5/18/2006 9:25:49 AM |
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