| 伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用 |
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| 引用本文： | 生秀梅,黄新祥,茅凌翔,朱超望,徐顺高,张海方,许化溪,刘秀梅. 伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用[J]. 生物化学与生物物理进展, 2009, 36(2): 206-212. DOI: 10.3724/SP.J.1206.2008.00373 |
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| 作者姓名： | 生秀梅 黄新祥 茅凌翔 朱超望 徐顺高 张海方 许化溪 刘秀梅 |
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| 作者单位： | 1. 江苏大学医学技术学院,镇江,212013
2. 中国疾病颅防控制中心营养与食品安全所,北京,100050 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(3057008)和国家科技支撑计划资助项目(2006BAK02A15). |
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| 摘 要： | 伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌，也是一种重要的原核生物研究用模式菌．基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较．利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列，以Ty2菌株的基因组为基准，选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因，设计特异性引物，经PCR有效扩增出4 201个基因，产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片，并验证了芯片样点位次与效果．通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化，建立相应的表达谱分析方法，并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异，结果与以前的报道基本一致．结果表明，成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法，可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持．
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| 关 键 词： | 伤寒沙门菌 基凶组DNA芯片 基因表达谱 |
| 收稿时间： | 2008-05-21 |
| 修稿时间： | 2008-07-15 |
Preparation of Salmonella enterica Serovar Typhi Genomic DNA Microarrays for Gene Expression Profiling Analysis |
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| SHENG Xiu-Mei,HUANG Xin-Xiang,MAO Ling-Xiang,ZHU Chao-Wang,XU Shun-Gao,ZHANG Hai-Fang,XU Hua-Xi and LIU Xiu-Mei. Preparation of Salmonella enterica Serovar Typhi Genomic DNA Microarrays for Gene Expression Profiling Analysis[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2009, 36(2): 206-212. DOI: 10.3724/SP.J.1206.2008.00373 |
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| Authors: | SHENG Xiu-Mei HUANG Xin-Xiang MAO Ling-Xiang ZHU Chao-Wang XU Shun-Gao ZHANG Hai-Fang XU Hua-Xi LIU Xiu-Mei |
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| Affiliation: | School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;School of Medical Technology, University of Jiangsu, Zhenjiang 212013, China;National Institute for Nutrition and Food Safety, Chinese Center for Disease Control and Prevention, Beijing 100050, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salmonella enterica serovar Typhi genomic DNA microarrays gene expression profile |
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